Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXB0

MKS1, Meckel syndrome type 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1Q9NXB0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MKS1Q9NXB0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MKS1Q9NXB0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MKS1Q9NXB0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MKS1Q9NXB0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MKS1Q9NXB0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MKS1Q9NXB0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MKS1Q9NXB0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MKS1Q9NXB0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MKS1Q9NXB0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MKS1Q9NXB0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MKS1Q9NXB0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MKS1Q9NXB0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MKS1Q9NXB0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MKS1Q9NXB0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MKS1Q9NXB0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MKS1Q9NXB0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MKS1Q9NXB0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MKS1Q9NXB0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
MKS1Q9NXB0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MKS1Q9NXB0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MKS1Q9NXB0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MKS1Q9NXB0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MKS1Q9NXB0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MKS1Q9NXB0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MKS1Q9NXB0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MKS1Q9NXB0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
MKS1Q9NXB0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MKS1Q9NXB0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MKS1Q9NXB0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MKS1Q9NXB0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MKS1Q9NXB0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MKS1Q9NXB0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
MKS1Q9NXB0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MKS1Q9NXB0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MKS1Q9NXB0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MKS1Q9NXB0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MKS1Q9NXB0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MKS1Q9NXB0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MKS1Q9NXB0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MKS1Q9NXB0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MKS1Q9NXB0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MKS1Q9NXB0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MKS1Q9NXB0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MKS1Q9NXB0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MKS1Q9NXB0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MKS1Q9NXB0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MKS1Q9NXB0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MKS1Q9NXB0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MKS1Q9NXB0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MKS1Q9NXB0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
MKS1Q9NXB0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MKS1Q9NXB0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MKS1Q9NXB0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MKS1Q9NXB0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MKS1Q9NXB0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MKS1Q9NXB0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MKS1Q9NXB0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MKS1Q9NXB0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MKS1Q9NXB0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MKS1Q9NXB0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MKS1Q9NXB0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MKS1Q9NXB0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MKS1Q9NXB0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MKS1Q9NXB0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MKS1Q9NXB0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MKS1Q9NXB0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MKS1Q9NXB0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MKS1Q9NXB0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MKS1Q9NXB0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MKS1Q9NXB0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MKS1Q9NXB0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
MKS1Q9NXB0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MKS1Q9NXB0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MKS1Q9NXB0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MKS1Q9NXB0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MKS1Q9NXB0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MKS1Q9NXB0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MKS1Q9NXB0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MKS1Q9NXB0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MKS1Q9NXB0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MKS1Q9NXB0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MKS1Q9NXB0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MKS1Q9NXB0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
MKS1Q9NXB0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MKS1Q9NXB0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MKS1Q9NXB0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MKS1Q9NXB0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MKS1Q9NXB0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MKS1Q9NXB0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MKS1Q9NXB0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MKS1Q9NXB0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MKS1Q9NXB0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MKS1Q9NXB0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MKS1Q9NXB0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MKS1Q9NXB0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MKS1Q9NXB0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MKS1Q9NXB0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MKS1Q9NXB0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MKS1Q9NXB0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms