Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
RTN4Q9NQC3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
RTN4Q9NQC3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
RTN4Q9NQC3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RTN4Q9NQC3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
RTN4Q9NQC3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
RTN4Q9NQC3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RTN4Q9NQC3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
RTN4Q9NQC3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
RTN4Q9NQC3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
RTN4Q9NQC3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
RTN4Q9NQC3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
RTN4Q9NQC3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
RTN4Q9NQC3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
RTN4Q9NQC3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.75
RTN4Q9NQC3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
RTN4Q9NQC3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
RTN4Q9NQC3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RTN4Q9NQC3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
RTN4Q9NQC3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
RTN4Q9NQC3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RTN4Q9NQC3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RTN4Q9NQC3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RTN4Q9NQC3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
RTN4Q9NQC3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
RTN4Q9NQC3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
RTN4Q9NQC3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
RTN4Q9NQC3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RTN4Q9NQC3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RTN4Q9NQC3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RTN4Q9NQC3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RTN4Q9NQC3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RTN4Q9NQC3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RTN4Q9NQC3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RTN4Q9NQC3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
RTN4Q9NQC3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RTN4Q9NQC3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
RTN4Q9NQC3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RTN4Q9NQC3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RTN4Q9NQC3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RTN4Q9NQC3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RTN4Q9NQC3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
RTN4Q9NQC3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
RTN4Q9NQC3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
RTN4Q9NQC3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
RTN4Q9NQC3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
RTN4Q9NQC3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
RTN4Q9NQC3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RTN4Q9NQC3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
RTN4Q9NQC3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
RTN4Q9NQC3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
RTN4Q9NQC3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
RTN4Q9NQC3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
RTN4Q9NQC3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
RTN4Q9NQC3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
RTN4Q9NQC3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
RTN4Q9NQC3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
RTN4Q9NQC3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
RTN4Q9NQC3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.85■■■□□ 2.69
RTN4Q9NQC3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
RTN4Q9NQC3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
RTN4Q9NQC3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
RTN4Q9NQC3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
RTN4Q9NQC3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
RTN4Q9NQC3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
RTN4Q9NQC3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
RTN4Q9NQC3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
RTN4Q9NQC3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
RTN4Q9NQC3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
RTN4Q9NQC3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
RTN4Q9NQC3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
RTN4Q9NQC3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
RTN4Q9NQC3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
RTN4Q9NQC3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
RTN4Q9NQC3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
RTN4Q9NQC3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
RTN4Q9NQC3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
RTN4Q9NQC3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
RTN4Q9NQC3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
RTN4Q9NQC3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
RTN4Q9NQC3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
RTN4Q9NQC3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
RTN4Q9NQC3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
RTN4Q9NQC3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
RTN4Q9NQC3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
RTN4Q9NQC3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
RTN4Q9NQC3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
RTN4Q9NQC3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
RTN4Q9NQC3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
RTN4Q9NQC3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
RTN4Q9NQC3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
RTN4Q9NQC3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
RTN4Q9NQC3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
RTN4Q9NQC3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
RTN4Q9NQC3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
RTN4Q9NQC3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
RTN4Q9NQC3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
RTN4Q9NQC3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
RTN4Q9NQC3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
RTN4Q9NQC3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms