Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP85

NPHS2, Podocin, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHS2Q9NP85 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NPHS2Q9NP85 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NPHS2Q9NP85 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NPHS2Q9NP85 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NPHS2Q9NP85 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NPHS2Q9NP85 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NPHS2Q9NP85 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NPHS2Q9NP85 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NPHS2Q9NP85 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NPHS2Q9NP85 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NPHS2Q9NP85 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPHS2Q9NP85 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPHS2Q9NP85 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPHS2Q9NP85 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPHS2Q9NP85 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPHS2Q9NP85 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPHS2Q9NP85 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NPHS2Q9NP85 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NPHS2Q9NP85 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NPHS2Q9NP85 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NPHS2Q9NP85 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NPHS2Q9NP85 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NPHS2Q9NP85 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPHS2Q9NP85 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPHS2Q9NP85 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NPHS2Q9NP85 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NPHS2Q9NP85 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NPHS2Q9NP85 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NPHS2Q9NP85 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NPHS2Q9NP85 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NPHS2Q9NP85 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NPHS2Q9NP85 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NPHS2Q9NP85 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NPHS2Q9NP85 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NPHS2Q9NP85 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NPHS2Q9NP85 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NPHS2Q9NP85 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NPHS2Q9NP85 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NPHS2Q9NP85 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NPHS2Q9NP85 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NPHS2Q9NP85 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NPHS2Q9NP85 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NPHS2Q9NP85 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NPHS2Q9NP85 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NPHS2Q9NP85 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NPHS2Q9NP85 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NPHS2Q9NP85 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NPHS2Q9NP85 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NPHS2Q9NP85 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NPHS2Q9NP85 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NPHS2Q9NP85 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NPHS2Q9NP85 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NPHS2Q9NP85 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NPHS2Q9NP85 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NPHS2Q9NP85 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NPHS2Q9NP85 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NPHS2Q9NP85 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NPHS2Q9NP85 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NPHS2Q9NP85 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NPHS2Q9NP85 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NPHS2Q9NP85 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NPHS2Q9NP85 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NPHS2Q9NP85 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NPHS2Q9NP85 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NPHS2Q9NP85 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NPHS2Q9NP85 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NPHS2Q9NP85 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NPHS2Q9NP85 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NPHS2Q9NP85 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NPHS2Q9NP85 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NPHS2Q9NP85 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPHS2Q9NP85 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NPHS2Q9NP85 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NPHS2Q9NP85 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NPHS2Q9NP85 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NPHS2Q9NP85 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NPHS2Q9NP85 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NPHS2Q9NP85 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NPHS2Q9NP85 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NPHS2Q9NP85 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NPHS2Q9NP85 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NPHS2Q9NP85 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPHS2Q9NP85 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NPHS2Q9NP85 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPHS2Q9NP85 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NPHS2Q9NP85 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NPHS2Q9NP85 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NPHS2Q9NP85 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NPHS2Q9NP85 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NPHS2Q9NP85 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NPHS2Q9NP85 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NPHS2Q9NP85 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NPHS2Q9NP85 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NPHS2Q9NP85 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NPHS2Q9NP85 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NPHS2Q9NP85 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NPHS2Q9NP85 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NPHS2Q9NP85 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NPHS2Q9NP85 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NPHS2Q9NP85 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114 ms