Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6Y7

RNF167, E3 ubiquitin-protein ligase RNF167, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF167Q9H6Y7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF167Q9H6Y7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF167Q9H6Y7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF167Q9H6Y7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF167Q9H6Y7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF167Q9H6Y7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF167Q9H6Y7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF167Q9H6Y7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF167Q9H6Y7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF167Q9H6Y7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF167Q9H6Y7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF167Q9H6Y7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF167Q9H6Y7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF167Q9H6Y7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RNF167Q9H6Y7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF167Q9H6Y7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF167Q9H6Y7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF167Q9H6Y7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF167Q9H6Y7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF167Q9H6Y7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF167Q9H6Y7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF167Q9H6Y7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF167Q9H6Y7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF167Q9H6Y7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF167Q9H6Y7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF167Q9H6Y7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF167Q9H6Y7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF167Q9H6Y7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF167Q9H6Y7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF167Q9H6Y7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF167Q9H6Y7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF167Q9H6Y7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF167Q9H6Y7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF167Q9H6Y7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF167Q9H6Y7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF167Q9H6Y7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF167Q9H6Y7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF167Q9H6Y7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF167Q9H6Y7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF167Q9H6Y7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF167Q9H6Y7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF167Q9H6Y7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF167Q9H6Y7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF167Q9H6Y7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF167Q9H6Y7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF167Q9H6Y7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF167Q9H6Y7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF167Q9H6Y7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF167Q9H6Y7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF167Q9H6Y7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF167Q9H6Y7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF167Q9H6Y7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF167Q9H6Y7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF167Q9H6Y7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF167Q9H6Y7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF167Q9H6Y7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF167Q9H6Y7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF167Q9H6Y7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF167Q9H6Y7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF167Q9H6Y7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF167Q9H6Y7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF167Q9H6Y7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF167Q9H6Y7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF167Q9H6Y7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF167Q9H6Y7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF167Q9H6Y7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF167Q9H6Y7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF167Q9H6Y7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF167Q9H6Y7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF167Q9H6Y7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF167Q9H6Y7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF167Q9H6Y7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF167Q9H6Y7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF167Q9H6Y7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF167Q9H6Y7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF167Q9H6Y7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF167Q9H6Y7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF167Q9H6Y7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF167Q9H6Y7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF167Q9H6Y7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF167Q9H6Y7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF167Q9H6Y7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF167Q9H6Y7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF167Q9H6Y7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF167Q9H6Y7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF167Q9H6Y7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF167Q9H6Y7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF167Q9H6Y7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF167Q9H6Y7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF167Q9H6Y7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF167Q9H6Y7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF167Q9H6Y7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF167Q9H6Y7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF167Q9H6Y7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF167Q9H6Y7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF167Q9H6Y7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF167Q9H6Y7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF167Q9H6Y7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF167Q9H6Y7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF167Q9H6Y7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms