Protein–RNA interactions for Protein: Q9H299

SH3BGRL3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3Q9H299 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3BGRL3Q9H299 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3BGRL3Q9H299 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3BGRL3Q9H299 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3BGRL3Q9H299 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3BGRL3Q9H299 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3BGRL3Q9H299 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3BGRL3Q9H299 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3BGRL3Q9H299 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3BGRL3Q9H299 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3BGRL3Q9H299 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3BGRL3Q9H299 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3BGRL3Q9H299 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3BGRL3Q9H299 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3BGRL3Q9H299 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3BGRL3Q9H299 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3BGRL3Q9H299 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3BGRL3Q9H299 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3BGRL3Q9H299 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3BGRL3Q9H299 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3BGRL3Q9H299 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SH3BGRL3Q9H299 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3BGRL3Q9H299 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3BGRL3Q9H299 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3BGRL3Q9H299 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3BGRL3Q9H299 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3BGRL3Q9H299 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BGRL3Q9H299 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BGRL3Q9H299 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BGRL3Q9H299 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BGRL3Q9H299 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BGRL3Q9H299 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BGRL3Q9H299 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BGRL3Q9H299 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3BGRL3Q9H299 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3BGRL3Q9H299 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3BGRL3Q9H299 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3BGRL3Q9H299 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3BGRL3Q9H299 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3BGRL3Q9H299 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3BGRL3Q9H299 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3BGRL3Q9H299 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3BGRL3Q9H299 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3BGRL3Q9H299 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3BGRL3Q9H299 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3BGRL3Q9H299 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3BGRL3Q9H299 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3BGRL3Q9H299 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3BGRL3Q9H299 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3BGRL3Q9H299 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3BGRL3Q9H299 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3BGRL3Q9H299 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3BGRL3Q9H299 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3BGRL3Q9H299 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3BGRL3Q9H299 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3BGRL3Q9H299 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3BGRL3Q9H299 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3BGRL3Q9H299 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3BGRL3Q9H299 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3BGRL3Q9H299 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3BGRL3Q9H299 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BGRL3Q9H299 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3BGRL3Q9H299 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3BGRL3Q9H299 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3BGRL3Q9H299 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BGRL3Q9H299 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BGRL3Q9H299 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BGRL3Q9H299 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3BGRL3Q9H299 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BGRL3Q9H299 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BGRL3Q9H299 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SH3BGRL3Q9H299 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3BGRL3Q9H299 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3BGRL3Q9H299 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3BGRL3Q9H299 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3BGRL3Q9H299 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BGRL3Q9H299 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3BGRL3Q9H299 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3BGRL3Q9H299 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3BGRL3Q9H299 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3BGRL3Q9H299 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BGRL3Q9H299 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BGRL3Q9H299 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3BGRL3Q9H299 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3BGRL3Q9H299 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3BGRL3Q9H299 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3BGRL3Q9H299 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3BGRL3Q9H299 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3BGRL3Q9H299 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3BGRL3Q9H299 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3BGRL3Q9H299 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BGRL3Q9H299 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BGRL3Q9H299 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BGRL3Q9H299 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BGRL3Q9H299 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3BGRL3Q9H299 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3BGRL3Q9H299 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3BGRL3Q9H299 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3BGRL3Q9H299 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3BGRL3Q9H299 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms