Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GINS3Q9BRX5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GINS3Q9BRX5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GINS3Q9BRX5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GINS3Q9BRX5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GINS3Q9BRX5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GINS3Q9BRX5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GINS3Q9BRX5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GINS3Q9BRX5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GINS3Q9BRX5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GINS3Q9BRX5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GINS3Q9BRX5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GINS3Q9BRX5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GINS3Q9BRX5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GINS3Q9BRX5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GINS3Q9BRX5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GINS3Q9BRX5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GINS3Q9BRX5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GINS3Q9BRX5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GINS3Q9BRX5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GINS3Q9BRX5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GINS3Q9BRX5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GINS3Q9BRX5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GINS3Q9BRX5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GINS3Q9BRX5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GINS3Q9BRX5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GINS3Q9BRX5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GINS3Q9BRX5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GINS3Q9BRX5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GINS3Q9BRX5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GINS3Q9BRX5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GINS3Q9BRX5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GINS3Q9BRX5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GINS3Q9BRX5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GINS3Q9BRX5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GINS3Q9BRX5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GINS3Q9BRX5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GINS3Q9BRX5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GINS3Q9BRX5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GINS3Q9BRX5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GINS3Q9BRX5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GINS3Q9BRX5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GINS3Q9BRX5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GINS3Q9BRX5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GINS3Q9BRX5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GINS3Q9BRX5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GINS3Q9BRX5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GINS3Q9BRX5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GINS3Q9BRX5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GINS3Q9BRX5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GINS3Q9BRX5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GINS3Q9BRX5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GINS3Q9BRX5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GINS3Q9BRX5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GINS3Q9BRX5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GINS3Q9BRX5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GINS3Q9BRX5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GINS3Q9BRX5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GINS3Q9BRX5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GINS3Q9BRX5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GINS3Q9BRX5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GINS3Q9BRX5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GINS3Q9BRX5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GINS3Q9BRX5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GINS3Q9BRX5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GINS3Q9BRX5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GINS3Q9BRX5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GINS3Q9BRX5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GINS3Q9BRX5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GINS3Q9BRX5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GINS3Q9BRX5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GINS3Q9BRX5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GINS3Q9BRX5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GINS3Q9BRX5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GINS3Q9BRX5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GINS3Q9BRX5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GINS3Q9BRX5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GINS3Q9BRX5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GINS3Q9BRX5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GINS3Q9BRX5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GINS3Q9BRX5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GINS3Q9BRX5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GINS3Q9BRX5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GINS3Q9BRX5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GINS3Q9BRX5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GINS3Q9BRX5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GINS3Q9BRX5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GINS3Q9BRX5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GINS3Q9BRX5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GINS3Q9BRX5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GINS3Q9BRX5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GINS3Q9BRX5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GINS3Q9BRX5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GINS3Q9BRX5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GINS3Q9BRX5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GINS3Q9BRX5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GINS3Q9BRX5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GINS3Q9BRX5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GINS3Q9BRX5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GINS3Q9BRX5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms