Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMIM7Q9BQ49 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMIM7Q9BQ49 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMIM7Q9BQ49 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMIM7Q9BQ49 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMIM7Q9BQ49 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SMIM7Q9BQ49 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMIM7Q9BQ49 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMIM7Q9BQ49 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMIM7Q9BQ49 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMIM7Q9BQ49 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMIM7Q9BQ49 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMIM7Q9BQ49 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMIM7Q9BQ49 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMIM7Q9BQ49 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMIM7Q9BQ49 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMIM7Q9BQ49 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMIM7Q9BQ49 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMIM7Q9BQ49 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMIM7Q9BQ49 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMIM7Q9BQ49 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMIM7Q9BQ49 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMIM7Q9BQ49 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMIM7Q9BQ49 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMIM7Q9BQ49 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMIM7Q9BQ49 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMIM7Q9BQ49 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMIM7Q9BQ49 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMIM7Q9BQ49 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMIM7Q9BQ49 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMIM7Q9BQ49 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMIM7Q9BQ49 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMIM7Q9BQ49 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMIM7Q9BQ49 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
SMIM7Q9BQ49 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMIM7Q9BQ49 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMIM7Q9BQ49 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMIM7Q9BQ49 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMIM7Q9BQ49 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMIM7Q9BQ49 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMIM7Q9BQ49 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM7Q9BQ49 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM7Q9BQ49 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMIM7Q9BQ49 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM7Q9BQ49 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM7Q9BQ49 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM7Q9BQ49 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM7Q9BQ49 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMIM7Q9BQ49 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMIM7Q9BQ49 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMIM7Q9BQ49 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMIM7Q9BQ49 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMIM7Q9BQ49 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMIM7Q9BQ49 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMIM7Q9BQ49 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMIM7Q9BQ49 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMIM7Q9BQ49 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMIM7Q9BQ49 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMIM7Q9BQ49 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMIM7Q9BQ49 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM7Q9BQ49 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMIM7Q9BQ49 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMIM7Q9BQ49 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMIM7Q9BQ49 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMIM7Q9BQ49 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMIM7Q9BQ49 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMIM7Q9BQ49 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMIM7Q9BQ49 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM7Q9BQ49 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM7Q9BQ49 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM7Q9BQ49 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM7Q9BQ49 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM7Q9BQ49 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM7Q9BQ49 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM7Q9BQ49 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMIM7Q9BQ49 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMIM7Q9BQ49 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMIM7Q9BQ49 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMIM7Q9BQ49 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMIM7Q9BQ49 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM7Q9BQ49 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM7Q9BQ49 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM7Q9BQ49 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMIM7Q9BQ49 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMIM7Q9BQ49 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMIM7Q9BQ49 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SMIM7Q9BQ49 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMIM7Q9BQ49 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMIM7Q9BQ49 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMIM7Q9BQ49 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMIM7Q9BQ49 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMIM7Q9BQ49 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM7Q9BQ49 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM7Q9BQ49 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM7Q9BQ49 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMIM7Q9BQ49 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMIM7Q9BQ49 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMIM7Q9BQ49 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SMIM7Q9BQ49 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM7Q9BQ49 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.6 ms