Protein–RNA interactions for Protein: Q99766

ATP5S, ATP synthase subunit s, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5SQ99766 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP5SQ99766 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP5SQ99766 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP5SQ99766 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP5SQ99766 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP5SQ99766 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP5SQ99766 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP5SQ99766 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP5SQ99766 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP5SQ99766 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP5SQ99766 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP5SQ99766 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP5SQ99766 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP5SQ99766 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP5SQ99766 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP5SQ99766 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP5SQ99766 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP5SQ99766 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP5SQ99766 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP5SQ99766 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP5SQ99766 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP5SQ99766 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP5SQ99766 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP5SQ99766 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP5SQ99766 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP5SQ99766 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP5SQ99766 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP5SQ99766 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP5SQ99766 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP5SQ99766 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP5SQ99766 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP5SQ99766 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP5SQ99766 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP5SQ99766 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP5SQ99766 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP5SQ99766 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP5SQ99766 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP5SQ99766 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP5SQ99766 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP5SQ99766 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5SQ99766 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5SQ99766 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5SQ99766 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5SQ99766 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP5SQ99766 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP5SQ99766 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP5SQ99766 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP5SQ99766 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP5SQ99766 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP5SQ99766 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP5SQ99766 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP5SQ99766 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP5SQ99766 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP5SQ99766 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP5SQ99766 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP5SQ99766 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP5SQ99766 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP5SQ99766 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP5SQ99766 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP5SQ99766 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP5SQ99766 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP5SQ99766 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP5SQ99766 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP5SQ99766 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP5SQ99766 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP5SQ99766 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP5SQ99766 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP5SQ99766 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP5SQ99766 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP5SQ99766 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP5SQ99766 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP5SQ99766 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATP5SQ99766 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATP5SQ99766 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP5SQ99766 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP5SQ99766 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP5SQ99766 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP5SQ99766 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP5SQ99766 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP5SQ99766 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP5SQ99766 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP5SQ99766 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP5SQ99766 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP5SQ99766 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP5SQ99766 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP5SQ99766 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP5SQ99766 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP5SQ99766 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP5SQ99766 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP5SQ99766 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP5SQ99766 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP5SQ99766 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP5SQ99766 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP5SQ99766 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP5SQ99766 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP5SQ99766 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP5SQ99766 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP5SQ99766 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP5SQ99766 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP5SQ99766 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms