Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN8

NEURL4, Neuralized-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL4Q96JN8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
NEURL4Q96JN8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC41.38■■■■■ 4.21
NEURL4Q96JN8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC41.35■■■■■ 4.21
NEURL4Q96JN8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.33■■■■■ 4.21
NEURL4Q96JN8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC41.3■■■■■ 4.2
NEURL4Q96JN8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
NEURL4Q96JN8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
NEURL4Q96JN8 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC41.27■■■■■ 4.2
NEURL4Q96JN8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
NEURL4Q96JN8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC41.25■■■■■ 4.19
NEURL4Q96JN8 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
NEURL4Q96JN8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
NEURL4Q96JN8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
NEURL4Q96JN8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC41.17■■■■■ 4.18
NEURL4Q96JN8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC41.17■■■■■ 4.18
NEURL4Q96JN8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC41.16■■■■■ 4.18
NEURL4Q96JN8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
NEURL4Q96JN8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC41.15■■■■■ 4.18
NEURL4Q96JN8 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
NEURL4Q96JN8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.17
NEURL4Q96JN8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC41.12■■■■■ 4.17
NEURL4Q96JN8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC41.12■■■■■ 4.17
NEURL4Q96JN8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC41.12■■■■■ 4.17
NEURL4Q96JN8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC41.11■■■■■ 4.17
NEURL4Q96JN8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
NEURL4Q96JN8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC41.05■■■■■ 4.16
NEURL4Q96JN8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
NEURL4Q96JN8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
NEURL4Q96JN8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC41.02■■■■■ 4.16
NEURL4Q96JN8 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
NEURL4Q96JN8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
NEURL4Q96JN8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.16
NEURL4Q96JN8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC41.01■■■■■ 4.16
NEURL4Q96JN8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.15
NEURL4Q96JN8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC41■■■■■ 4.15
NEURL4Q96JN8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41■■■■■ 4.15
NEURL4Q96JN8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
NEURL4Q96JN8 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
NEURL4Q96JN8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC40.94■■■■■ 4.14
NEURL4Q96JN8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
NEURL4Q96JN8 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
NEURL4Q96JN8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC40.91■■■■■ 4.14
NEURL4Q96JN8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
NEURL4Q96JN8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC40.9■■■■■ 4.14
NEURL4Q96JN8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
NEURL4Q96JN8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.13
NEURL4Q96JN8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.13
NEURL4Q96JN8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC40.86■■■■■ 4.13
NEURL4Q96JN8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC40.84■■■■■ 4.13
NEURL4Q96JN8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.82■■■■■ 4.13
NEURL4Q96JN8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
NEURL4Q96JN8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.81■■■■■ 4.12
NEURL4Q96JN8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.81■■■■■ 4.12
NEURL4Q96JN8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC40.81■■■■■ 4.12
NEURL4Q96JN8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC40.8■■■■■ 4.12
NEURL4Q96JN8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC40.77■■■■■ 4.12
NEURL4Q96JN8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.11
NEURL4Q96JN8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
NEURL4Q96JN8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
NEURL4Q96JN8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.69■■■■■ 4.11
NEURL4Q96JN8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
NEURL4Q96JN8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
NEURL4Q96JN8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
NEURL4Q96JN8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.67■■■■■ 4.1
NEURL4Q96JN8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
NEURL4Q96JN8 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
NEURL4Q96JN8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
NEURL4Q96JN8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
NEURL4Q96JN8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
NEURL4Q96JN8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
NEURL4Q96JN8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
NEURL4Q96JN8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
NEURL4Q96JN8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC40.57■■■■■ 4.08
NEURL4Q96JN8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.08
NEURL4Q96JN8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC40.56■■■■■ 4.08
NEURL4Q96JN8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
NEURL4Q96JN8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC40.55■■■■■ 4.08
NEURL4Q96JN8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC40.54■■■■■ 4.08
NEURL4Q96JN8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC40.53■■■■■ 4.08
NEURL4Q96JN8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
NEURL4Q96JN8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC40.53■■■■■ 4.08
NEURL4Q96JN8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
NEURL4Q96JN8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
NEURL4Q96JN8 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
NEURL4Q96JN8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
NEURL4Q96JN8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC40.48■■■■■ 4.07
NEURL4Q96JN8 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
NEURL4Q96JN8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
NEURL4Q96JN8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
NEURL4Q96JN8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
NEURL4Q96JN8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC40.45■■■■■ 4.07
NEURL4Q96JN8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
NEURL4Q96JN8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
NEURL4Q96JN8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40.41■■■■■ 4.06
NEURL4Q96JN8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
NEURL4Q96JN8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
NEURL4Q96JN8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
NEURL4Q96JN8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.06
NEURL4Q96JN8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
NEURL4Q96JN8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC40.37■■■■■ 4.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms