Protein–RNA interactions for Protein: Q96FV9

THOC1, THO complex subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOC1Q96FV9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
THOC1Q96FV9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
THOC1Q96FV9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
THOC1Q96FV9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
THOC1Q96FV9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
THOC1Q96FV9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
THOC1Q96FV9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
THOC1Q96FV9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
THOC1Q96FV9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
THOC1Q96FV9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
THOC1Q96FV9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
THOC1Q96FV9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
THOC1Q96FV9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
THOC1Q96FV9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
THOC1Q96FV9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
THOC1Q96FV9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
THOC1Q96FV9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
THOC1Q96FV9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
THOC1Q96FV9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
THOC1Q96FV9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
THOC1Q96FV9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
THOC1Q96FV9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
THOC1Q96FV9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
THOC1Q96FV9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
THOC1Q96FV9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
THOC1Q96FV9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
THOC1Q96FV9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
THOC1Q96FV9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
THOC1Q96FV9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
THOC1Q96FV9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
THOC1Q96FV9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
THOC1Q96FV9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
THOC1Q96FV9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
THOC1Q96FV9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
THOC1Q96FV9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
THOC1Q96FV9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
THOC1Q96FV9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
THOC1Q96FV9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
THOC1Q96FV9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
THOC1Q96FV9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
THOC1Q96FV9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
THOC1Q96FV9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
THOC1Q96FV9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
THOC1Q96FV9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
THOC1Q96FV9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
THOC1Q96FV9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
THOC1Q96FV9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
THOC1Q96FV9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
THOC1Q96FV9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
THOC1Q96FV9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
THOC1Q96FV9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
THOC1Q96FV9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
THOC1Q96FV9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
THOC1Q96FV9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
THOC1Q96FV9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
THOC1Q96FV9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
THOC1Q96FV9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
THOC1Q96FV9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
THOC1Q96FV9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
THOC1Q96FV9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
THOC1Q96FV9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
THOC1Q96FV9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
THOC1Q96FV9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
THOC1Q96FV9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
THOC1Q96FV9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
THOC1Q96FV9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
THOC1Q96FV9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
THOC1Q96FV9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
THOC1Q96FV9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
THOC1Q96FV9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
THOC1Q96FV9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
THOC1Q96FV9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
THOC1Q96FV9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
THOC1Q96FV9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
THOC1Q96FV9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
THOC1Q96FV9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
THOC1Q96FV9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
THOC1Q96FV9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
THOC1Q96FV9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
THOC1Q96FV9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
THOC1Q96FV9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
THOC1Q96FV9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
THOC1Q96FV9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
THOC1Q96FV9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
THOC1Q96FV9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
THOC1Q96FV9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
THOC1Q96FV9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
THOC1Q96FV9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
THOC1Q96FV9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
THOC1Q96FV9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
THOC1Q96FV9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
THOC1Q96FV9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
THOC1Q96FV9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
THOC1Q96FV9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
THOC1Q96FV9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
THOC1Q96FV9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
THOC1Q96FV9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
THOC1Q96FV9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
THOC1Q96FV9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
THOC1Q96FV9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms