Protein–RNA interactions for Protein: Q92769

HDAC2, Histone deacetylase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2Q92769 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDAC2Q92769 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDAC2Q92769 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDAC2Q92769 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDAC2Q92769 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDAC2Q92769 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDAC2Q92769 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC2Q92769 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC2Q92769 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC2Q92769 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC2Q92769 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HDAC2Q92769 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HDAC2Q92769 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDAC2Q92769 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDAC2Q92769 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDAC2Q92769 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDAC2Q92769 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HDAC2Q92769 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
HDAC2Q92769 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC2Q92769 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HDAC2Q92769 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDAC2Q92769 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDAC2Q92769 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDAC2Q92769 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDAC2Q92769 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDAC2Q92769 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
HDAC2Q92769 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDAC2Q92769 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDAC2Q92769 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
HDAC2Q92769 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDAC2Q92769 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDAC2Q92769 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDAC2Q92769 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC2Q92769 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC2Q92769 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC2Q92769 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC2Q92769 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC2Q92769 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC2Q92769 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC2Q92769 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC2Q92769 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC2Q92769 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC2Q92769 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC2Q92769 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC2Q92769 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC2Q92769 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC2Q92769 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC2Q92769 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDAC2Q92769 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC2Q92769 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC2Q92769 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC2Q92769 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDAC2Q92769 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDAC2Q92769 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDAC2Q92769 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDAC2Q92769 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC2Q92769 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDAC2Q92769 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HDAC2Q92769 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HDAC2Q92769 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HDAC2Q92769 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC2Q92769 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC2Q92769 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDAC2Q92769 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDAC2Q92769 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDAC2Q92769 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDAC2Q92769 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC2Q92769 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDAC2Q92769 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDAC2Q92769 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDAC2Q92769 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDAC2Q92769 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC2Q92769 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDAC2Q92769 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDAC2Q92769 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDAC2Q92769 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDAC2Q92769 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDAC2Q92769 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDAC2Q92769 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC2Q92769 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC2Q92769 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC2Q92769 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDAC2Q92769 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDAC2Q92769 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDAC2Q92769 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC2Q92769 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC2Q92769 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC2Q92769 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC2Q92769 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC2Q92769 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC2Q92769 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDAC2Q92769 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC2Q92769 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC2Q92769 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC2Q92769 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC2Q92769 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC2Q92769 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC2Q92769 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC2Q92769 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC2Q92769 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms