Protein–RNA interactions for Protein: Q92629

SGCD, Delta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCDQ92629 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SGCDQ92629 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SGCDQ92629 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGCDQ92629 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGCDQ92629 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGCDQ92629 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SGCDQ92629 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SGCDQ92629 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SGCDQ92629 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SGCDQ92629 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SGCDQ92629 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGCDQ92629 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGCDQ92629 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SGCDQ92629 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SGCDQ92629 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SGCDQ92629 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SGCDQ92629 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SGCDQ92629 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SGCDQ92629 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGCDQ92629 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGCDQ92629 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SGCDQ92629 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SGCDQ92629 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SGCDQ92629 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SGCDQ92629 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SGCDQ92629 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SGCDQ92629 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SGCDQ92629 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGCDQ92629 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SGCDQ92629 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SGCDQ92629 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SGCDQ92629 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SGCDQ92629 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SGCDQ92629 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SGCDQ92629 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SGCDQ92629 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SGCDQ92629 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SGCDQ92629 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SGCDQ92629 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SGCDQ92629 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SGCDQ92629 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SGCDQ92629 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SGCDQ92629 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SGCDQ92629 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SGCDQ92629 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SGCDQ92629 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SGCDQ92629 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SGCDQ92629 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SGCDQ92629 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SGCDQ92629 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SGCDQ92629 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SGCDQ92629 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SGCDQ92629 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SGCDQ92629 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SGCDQ92629 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGCDQ92629 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SGCDQ92629 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SGCDQ92629 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SGCDQ92629 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SGCDQ92629 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SGCDQ92629 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SGCDQ92629 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SGCDQ92629 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SGCDQ92629 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SGCDQ92629 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SGCDQ92629 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SGCDQ92629 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SGCDQ92629 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SGCDQ92629 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGCDQ92629 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGCDQ92629 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGCDQ92629 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SGCDQ92629 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SGCDQ92629 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SGCDQ92629 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SGCDQ92629 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SGCDQ92629 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SGCDQ92629 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SGCDQ92629 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SGCDQ92629 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SGCDQ92629 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SGCDQ92629 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SGCDQ92629 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SGCDQ92629 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SGCDQ92629 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SGCDQ92629 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SGCDQ92629 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SGCDQ92629 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SGCDQ92629 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SGCDQ92629 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SGCDQ92629 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SGCDQ92629 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SGCDQ92629 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SGCDQ92629 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SGCDQ92629 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SGCDQ92629 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SGCDQ92629 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SGCDQ92629 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SGCDQ92629 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SGCDQ92629 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms