Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
UBXN4Q92575 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
UBXN4Q92575 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
UBXN4Q92575 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
UBXN4Q92575 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
UBXN4Q92575 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
UBXN4Q92575 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
UBXN4Q92575 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
UBXN4Q92575 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
UBXN4Q92575 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
UBXN4Q92575 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
UBXN4Q92575 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
UBXN4Q92575 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
UBXN4Q92575 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
UBXN4Q92575 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
UBXN4Q92575 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
UBXN4Q92575 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
UBXN4Q92575 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
UBXN4Q92575 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
UBXN4Q92575 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
UBXN4Q92575 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
UBXN4Q92575 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
UBXN4Q92575 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
UBXN4Q92575 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
UBXN4Q92575 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
UBXN4Q92575 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
UBXN4Q92575 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
UBXN4Q92575 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
UBXN4Q92575 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
UBXN4Q92575 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
UBXN4Q92575 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
UBXN4Q92575 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
UBXN4Q92575 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
UBXN4Q92575 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
UBXN4Q92575 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
UBXN4Q92575 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
UBXN4Q92575 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
UBXN4Q92575 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
UBXN4Q92575 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
UBXN4Q92575 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
UBXN4Q92575 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
UBXN4Q92575 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
UBXN4Q92575 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
UBXN4Q92575 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
UBXN4Q92575 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
UBXN4Q92575 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
UBXN4Q92575 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
UBXN4Q92575 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
UBXN4Q92575 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
UBXN4Q92575 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
UBXN4Q92575 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
UBXN4Q92575 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
UBXN4Q92575 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
UBXN4Q92575 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
UBXN4Q92575 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
UBXN4Q92575 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
UBXN4Q92575 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
UBXN4Q92575 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
UBXN4Q92575 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
UBXN4Q92575 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
UBXN4Q92575 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
UBXN4Q92575 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
UBXN4Q92575 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
UBXN4Q92575 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
UBXN4Q92575 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
UBXN4Q92575 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
UBXN4Q92575 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
UBXN4Q92575 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
UBXN4Q92575 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
UBXN4Q92575 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
UBXN4Q92575 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
UBXN4Q92575 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
UBXN4Q92575 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
UBXN4Q92575 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
UBXN4Q92575 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
UBXN4Q92575 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
UBXN4Q92575 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
UBXN4Q92575 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
UBXN4Q92575 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
UBXN4Q92575 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
UBXN4Q92575 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
UBXN4Q92575 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
UBXN4Q92575 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
UBXN4Q92575 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
UBXN4Q92575 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
UBXN4Q92575 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
UBXN4Q92575 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
UBXN4Q92575 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
UBXN4Q92575 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
UBXN4Q92575 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
UBXN4Q92575 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
UBXN4Q92575 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
UBXN4Q92575 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
UBXN4Q92575 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
UBXN4Q92575 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
UBXN4Q92575 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
UBXN4Q92575 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
UBXN4Q92575 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
UBXN4Q92575 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
UBXN4Q92575 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms