Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD47

RPS4Y2, 40S ribosomal protein S4, Y isoform 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4Y2Q8TD47 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPS4Y2Q8TD47 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS4Y2Q8TD47 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS4Y2Q8TD47 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS4Y2Q8TD47 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS4Y2Q8TD47 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS4Y2Q8TD47 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPS4Y2Q8TD47 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS4Y2Q8TD47 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPS4Y2Q8TD47 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS4Y2Q8TD47 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPS4Y2Q8TD47 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPS4Y2Q8TD47 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPS4Y2Q8TD47 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPS4Y2Q8TD47 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS4Y2Q8TD47 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS4Y2Q8TD47 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS4Y2Q8TD47 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS4Y2Q8TD47 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS4Y2Q8TD47 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPS4Y2Q8TD47 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS4Y2Q8TD47 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS4Y2Q8TD47 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS4Y2Q8TD47 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPS4Y2Q8TD47 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPS4Y2Q8TD47 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPS4Y2Q8TD47 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPS4Y2Q8TD47 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPS4Y2Q8TD47 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPS4Y2Q8TD47 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPS4Y2Q8TD47 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPS4Y2Q8TD47 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPS4Y2Q8TD47 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS4Y2Q8TD47 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS4Y2Q8TD47 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS4Y2Q8TD47 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS4Y2Q8TD47 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS4Y2Q8TD47 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS4Y2Q8TD47 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS4Y2Q8TD47 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS4Y2Q8TD47 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS4Y2Q8TD47 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS4Y2Q8TD47 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS4Y2Q8TD47 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS4Y2Q8TD47 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS4Y2Q8TD47 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS4Y2Q8TD47 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS4Y2Q8TD47 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS4Y2Q8TD47 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS4Y2Q8TD47 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS4Y2Q8TD47 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS4Y2Q8TD47 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS4Y2Q8TD47 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS4Y2Q8TD47 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS4Y2Q8TD47 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS4Y2Q8TD47 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS4Y2Q8TD47 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS4Y2Q8TD47 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS4Y2Q8TD47 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS4Y2Q8TD47 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS4Y2Q8TD47 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS4Y2Q8TD47 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS4Y2Q8TD47 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS4Y2Q8TD47 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS4Y2Q8TD47 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS4Y2Q8TD47 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS4Y2Q8TD47 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS4Y2Q8TD47 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS4Y2Q8TD47 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS4Y2Q8TD47 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS4Y2Q8TD47 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPS4Y2Q8TD47 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RPS4Y2Q8TD47 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS4Y2Q8TD47 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS4Y2Q8TD47 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS4Y2Q8TD47 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS4Y2Q8TD47 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS4Y2Q8TD47 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS4Y2Q8TD47 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RPS4Y2Q8TD47 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPS4Y2Q8TD47 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RPS4Y2Q8TD47 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS4Y2Q8TD47 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS4Y2Q8TD47 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS4Y2Q8TD47 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS4Y2Q8TD47 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS4Y2Q8TD47 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS4Y2Q8TD47 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS4Y2Q8TD47 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS4Y2Q8TD47 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS4Y2Q8TD47 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS4Y2Q8TD47 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS4Y2Q8TD47 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS4Y2Q8TD47 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS4Y2Q8TD47 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS4Y2Q8TD47 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS4Y2Q8TD47 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS4Y2Q8TD47 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS4Y2Q8TD47 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS4Y2Q8TD47 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms