Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBF2

FAM213B, Prostamide/prostaglandin F synthase, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM213BQ8TBF2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM213BQ8TBF2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM213BQ8TBF2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM213BQ8TBF2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM213BQ8TBF2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM213BQ8TBF2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM213BQ8TBF2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM213BQ8TBF2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM213BQ8TBF2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM213BQ8TBF2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM213BQ8TBF2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM213BQ8TBF2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM213BQ8TBF2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM213BQ8TBF2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM213BQ8TBF2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM213BQ8TBF2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM213BQ8TBF2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM213BQ8TBF2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM213BQ8TBF2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM213BQ8TBF2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM213BQ8TBF2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM213BQ8TBF2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM213BQ8TBF2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM213BQ8TBF2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM213BQ8TBF2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM213BQ8TBF2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM213BQ8TBF2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM213BQ8TBF2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM213BQ8TBF2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM213BQ8TBF2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM213BQ8TBF2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM213BQ8TBF2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM213BQ8TBF2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM213BQ8TBF2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM213BQ8TBF2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM213BQ8TBF2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM213BQ8TBF2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM213BQ8TBF2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM213BQ8TBF2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM213BQ8TBF2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM213BQ8TBF2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM213BQ8TBF2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM213BQ8TBF2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM213BQ8TBF2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM213BQ8TBF2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM213BQ8TBF2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM213BQ8TBF2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM213BQ8TBF2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM213BQ8TBF2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM213BQ8TBF2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM213BQ8TBF2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM213BQ8TBF2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM213BQ8TBF2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM213BQ8TBF2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM213BQ8TBF2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM213BQ8TBF2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM213BQ8TBF2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM213BQ8TBF2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM213BQ8TBF2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM213BQ8TBF2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM213BQ8TBF2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM213BQ8TBF2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM213BQ8TBF2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM213BQ8TBF2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM213BQ8TBF2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM213BQ8TBF2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM213BQ8TBF2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM213BQ8TBF2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM213BQ8TBF2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM213BQ8TBF2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM213BQ8TBF2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM213BQ8TBF2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM213BQ8TBF2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM213BQ8TBF2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM213BQ8TBF2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM213BQ8TBF2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM213BQ8TBF2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM213BQ8TBF2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM213BQ8TBF2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM213BQ8TBF2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM213BQ8TBF2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM213BQ8TBF2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM213BQ8TBF2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM213BQ8TBF2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM213BQ8TBF2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM213BQ8TBF2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM213BQ8TBF2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM213BQ8TBF2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAM213BQ8TBF2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM213BQ8TBF2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM213BQ8TBF2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM213BQ8TBF2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM213BQ8TBF2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM213BQ8TBF2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM213BQ8TBF2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM213BQ8TBF2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM213BQ8TBF2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM213BQ8TBF2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM213BQ8TBF2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM213BQ8TBF2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms