Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAT5

NEIL3, Endonuclease 8-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL3Q8TAT5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NEIL3Q8TAT5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEIL3Q8TAT5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEIL3Q8TAT5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEIL3Q8TAT5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEIL3Q8TAT5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEIL3Q8TAT5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEIL3Q8TAT5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEIL3Q8TAT5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEIL3Q8TAT5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEIL3Q8TAT5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEIL3Q8TAT5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEIL3Q8TAT5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEIL3Q8TAT5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEIL3Q8TAT5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEIL3Q8TAT5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEIL3Q8TAT5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEIL3Q8TAT5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEIL3Q8TAT5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEIL3Q8TAT5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEIL3Q8TAT5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEIL3Q8TAT5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEIL3Q8TAT5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEIL3Q8TAT5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEIL3Q8TAT5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEIL3Q8TAT5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEIL3Q8TAT5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEIL3Q8TAT5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEIL3Q8TAT5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEIL3Q8TAT5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEIL3Q8TAT5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEIL3Q8TAT5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEIL3Q8TAT5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NEIL3Q8TAT5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEIL3Q8TAT5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEIL3Q8TAT5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEIL3Q8TAT5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEIL3Q8TAT5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEIL3Q8TAT5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEIL3Q8TAT5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEIL3Q8TAT5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEIL3Q8TAT5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEIL3Q8TAT5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NEIL3Q8TAT5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEIL3Q8TAT5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEIL3Q8TAT5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEIL3Q8TAT5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEIL3Q8TAT5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEIL3Q8TAT5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEIL3Q8TAT5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEIL3Q8TAT5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEIL3Q8TAT5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEIL3Q8TAT5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NEIL3Q8TAT5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEIL3Q8TAT5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEIL3Q8TAT5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEIL3Q8TAT5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEIL3Q8TAT5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEIL3Q8TAT5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEIL3Q8TAT5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEIL3Q8TAT5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NEIL3Q8TAT5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEIL3Q8TAT5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEIL3Q8TAT5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEIL3Q8TAT5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEIL3Q8TAT5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEIL3Q8TAT5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEIL3Q8TAT5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEIL3Q8TAT5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEIL3Q8TAT5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEIL3Q8TAT5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEIL3Q8TAT5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEIL3Q8TAT5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEIL3Q8TAT5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEIL3Q8TAT5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEIL3Q8TAT5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEIL3Q8TAT5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEIL3Q8TAT5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEIL3Q8TAT5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEIL3Q8TAT5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEIL3Q8TAT5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEIL3Q8TAT5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEIL3Q8TAT5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEIL3Q8TAT5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEIL3Q8TAT5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEIL3Q8TAT5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEIL3Q8TAT5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEIL3Q8TAT5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NEIL3Q8TAT5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEIL3Q8TAT5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NEIL3Q8TAT5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEIL3Q8TAT5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEIL3Q8TAT5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEIL3Q8TAT5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEIL3Q8TAT5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEIL3Q8TAT5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEIL3Q8TAT5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEIL3Q8TAT5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEIL3Q8TAT5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEIL3Q8TAT5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms