Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE63

HIPK4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK4Q8NE63 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HIPK4Q8NE63 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HIPK4Q8NE63 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HIPK4Q8NE63 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HIPK4Q8NE63 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HIPK4Q8NE63 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HIPK4Q8NE63 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HIPK4Q8NE63 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HIPK4Q8NE63 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HIPK4Q8NE63 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
HIPK4Q8NE63 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HIPK4Q8NE63 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HIPK4Q8NE63 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HIPK4Q8NE63 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HIPK4Q8NE63 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HIPK4Q8NE63 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HIPK4Q8NE63 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HIPK4Q8NE63 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HIPK4Q8NE63 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HIPK4Q8NE63 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HIPK4Q8NE63 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HIPK4Q8NE63 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HIPK4Q8NE63 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HIPK4Q8NE63 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HIPK4Q8NE63 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HIPK4Q8NE63 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HIPK4Q8NE63 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HIPK4Q8NE63 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HIPK4Q8NE63 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HIPK4Q8NE63 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HIPK4Q8NE63 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HIPK4Q8NE63 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HIPK4Q8NE63 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HIPK4Q8NE63 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HIPK4Q8NE63 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HIPK4Q8NE63 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
HIPK4Q8NE63 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HIPK4Q8NE63 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HIPK4Q8NE63 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HIPK4Q8NE63 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HIPK4Q8NE63 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HIPK4Q8NE63 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HIPK4Q8NE63 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HIPK4Q8NE63 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HIPK4Q8NE63 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HIPK4Q8NE63 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HIPK4Q8NE63 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HIPK4Q8NE63 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HIPK4Q8NE63 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HIPK4Q8NE63 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
HIPK4Q8NE63 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
HIPK4Q8NE63 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HIPK4Q8NE63 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HIPK4Q8NE63 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HIPK4Q8NE63 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HIPK4Q8NE63 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HIPK4Q8NE63 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HIPK4Q8NE63 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HIPK4Q8NE63 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HIPK4Q8NE63 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HIPK4Q8NE63 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HIPK4Q8NE63 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HIPK4Q8NE63 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HIPK4Q8NE63 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HIPK4Q8NE63 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HIPK4Q8NE63 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
HIPK4Q8NE63 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HIPK4Q8NE63 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HIPK4Q8NE63 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HIPK4Q8NE63 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HIPK4Q8NE63 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HIPK4Q8NE63 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HIPK4Q8NE63 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HIPK4Q8NE63 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HIPK4Q8NE63 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HIPK4Q8NE63 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
HIPK4Q8NE63 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HIPK4Q8NE63 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HIPK4Q8NE63 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HIPK4Q8NE63 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HIPK4Q8NE63 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HIPK4Q8NE63 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HIPK4Q8NE63 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HIPK4Q8NE63 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HIPK4Q8NE63 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HIPK4Q8NE63 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HIPK4Q8NE63 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HIPK4Q8NE63 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HIPK4Q8NE63 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HIPK4Q8NE63 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HIPK4Q8NE63 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HIPK4Q8NE63 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HIPK4Q8NE63 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HIPK4Q8NE63 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
HIPK4Q8NE63 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HIPK4Q8NE63 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HIPK4Q8NE63 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HIPK4Q8NE63 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HIPK4Q8NE63 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HIPK4Q8NE63 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms