Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DTX3Q8N9I9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DTX3Q8N9I9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DTX3Q8N9I9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DTX3Q8N9I9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DTX3Q8N9I9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DTX3Q8N9I9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DTX3Q8N9I9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DTX3Q8N9I9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DTX3Q8N9I9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DTX3Q8N9I9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DTX3Q8N9I9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DTX3Q8N9I9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DTX3Q8N9I9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DTX3Q8N9I9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DTX3Q8N9I9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DTX3Q8N9I9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DTX3Q8N9I9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DTX3Q8N9I9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DTX3Q8N9I9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DTX3Q8N9I9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DTX3Q8N9I9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DTX3Q8N9I9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DTX3Q8N9I9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DTX3Q8N9I9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DTX3Q8N9I9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DTX3Q8N9I9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DTX3Q8N9I9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DTX3Q8N9I9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DTX3Q8N9I9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DTX3Q8N9I9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DTX3Q8N9I9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DTX3Q8N9I9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DTX3Q8N9I9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DTX3Q8N9I9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DTX3Q8N9I9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DTX3Q8N9I9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DTX3Q8N9I9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DTX3Q8N9I9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DTX3Q8N9I9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DTX3Q8N9I9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DTX3Q8N9I9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DTX3Q8N9I9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DTX3Q8N9I9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DTX3Q8N9I9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DTX3Q8N9I9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DTX3Q8N9I9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DTX3Q8N9I9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DTX3Q8N9I9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DTX3Q8N9I9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DTX3Q8N9I9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DTX3Q8N9I9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DTX3Q8N9I9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DTX3Q8N9I9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DTX3Q8N9I9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DTX3Q8N9I9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DTX3Q8N9I9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DTX3Q8N9I9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DTX3Q8N9I9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DTX3Q8N9I9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DTX3Q8N9I9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DTX3Q8N9I9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DTX3Q8N9I9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DTX3Q8N9I9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DTX3Q8N9I9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DTX3Q8N9I9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DTX3Q8N9I9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DTX3Q8N9I9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DTX3Q8N9I9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DTX3Q8N9I9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DTX3Q8N9I9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DTX3Q8N9I9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DTX3Q8N9I9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DTX3Q8N9I9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DTX3Q8N9I9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DTX3Q8N9I9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DTX3Q8N9I9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DTX3Q8N9I9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DTX3Q8N9I9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DTX3Q8N9I9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DTX3Q8N9I9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DTX3Q8N9I9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DTX3Q8N9I9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DTX3Q8N9I9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DTX3Q8N9I9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DTX3Q8N9I9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DTX3Q8N9I9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
DTX3Q8N9I9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DTX3Q8N9I9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DTX3Q8N9I9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DTX3Q8N9I9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DTX3Q8N9I9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DTX3Q8N9I9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DTX3Q8N9I9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DTX3Q8N9I9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DTX3Q8N9I9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DTX3Q8N9I9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DTX3Q8N9I9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DTX3Q8N9I9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DTX3Q8N9I9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms