Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5U1

MS4A15, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 15, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A15Q8N5U1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MS4A15Q8N5U1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MS4A15Q8N5U1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A15Q8N5U1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MS4A15Q8N5U1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MS4A15Q8N5U1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MS4A15Q8N5U1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MS4A15Q8N5U1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MS4A15Q8N5U1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MS4A15Q8N5U1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MS4A15Q8N5U1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MS4A15Q8N5U1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MS4A15Q8N5U1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MS4A15Q8N5U1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MS4A15Q8N5U1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MS4A15Q8N5U1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MS4A15Q8N5U1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MS4A15Q8N5U1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MS4A15Q8N5U1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MS4A15Q8N5U1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MS4A15Q8N5U1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MS4A15Q8N5U1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MS4A15Q8N5U1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MS4A15Q8N5U1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MS4A15Q8N5U1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MS4A15Q8N5U1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MS4A15Q8N5U1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MS4A15Q8N5U1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MS4A15Q8N5U1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MS4A15Q8N5U1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MS4A15Q8N5U1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MS4A15Q8N5U1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MS4A15Q8N5U1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MS4A15Q8N5U1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MS4A15Q8N5U1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MS4A15Q8N5U1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MS4A15Q8N5U1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MS4A15Q8N5U1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MS4A15Q8N5U1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MS4A15Q8N5U1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MS4A15Q8N5U1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MS4A15Q8N5U1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MS4A15Q8N5U1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A15Q8N5U1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A15Q8N5U1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A15Q8N5U1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A15Q8N5U1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A15Q8N5U1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A15Q8N5U1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A15Q8N5U1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A15Q8N5U1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A15Q8N5U1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MS4A15Q8N5U1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MS4A15Q8N5U1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MS4A15Q8N5U1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MS4A15Q8N5U1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MS4A15Q8N5U1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A15Q8N5U1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MS4A15Q8N5U1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MS4A15Q8N5U1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MS4A15Q8N5U1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MS4A15Q8N5U1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MS4A15Q8N5U1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MS4A15Q8N5U1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MS4A15Q8N5U1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A15Q8N5U1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MS4A15Q8N5U1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MS4A15Q8N5U1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MS4A15Q8N5U1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MS4A15Q8N5U1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MS4A15Q8N5U1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MS4A15Q8N5U1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MS4A15Q8N5U1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A15Q8N5U1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A15Q8N5U1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A15Q8N5U1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MS4A15Q8N5U1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MS4A15Q8N5U1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MS4A15Q8N5U1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MS4A15Q8N5U1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MS4A15Q8N5U1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MS4A15Q8N5U1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MS4A15Q8N5U1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MS4A15Q8N5U1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MS4A15Q8N5U1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MS4A15Q8N5U1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MS4A15Q8N5U1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MS4A15Q8N5U1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MS4A15Q8N5U1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MS4A15Q8N5U1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MS4A15Q8N5U1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MS4A15Q8N5U1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MS4A15Q8N5U1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MS4A15Q8N5U1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A15Q8N5U1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A15Q8N5U1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A15Q8N5U1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A15Q8N5U1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A15Q8N5U1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A15Q8N5U1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms