Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SVOPQ8N4V2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SVOPQ8N4V2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SVOPQ8N4V2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SVOPQ8N4V2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SVOPQ8N4V2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SVOPQ8N4V2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SVOPQ8N4V2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SVOPQ8N4V2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SVOPQ8N4V2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SVOPQ8N4V2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SVOPQ8N4V2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SVOPQ8N4V2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SVOPQ8N4V2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SVOPQ8N4V2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SVOPQ8N4V2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SVOPQ8N4V2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SVOPQ8N4V2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SVOPQ8N4V2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SVOPQ8N4V2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SVOPQ8N4V2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SVOPQ8N4V2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SVOPQ8N4V2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SVOPQ8N4V2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SVOPQ8N4V2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SVOPQ8N4V2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SVOPQ8N4V2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SVOPQ8N4V2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SVOPQ8N4V2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SVOPQ8N4V2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SVOPQ8N4V2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SVOPQ8N4V2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SVOPQ8N4V2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SVOPQ8N4V2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SVOPQ8N4V2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SVOPQ8N4V2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SVOPQ8N4V2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SVOPQ8N4V2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SVOPQ8N4V2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SVOPQ8N4V2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SVOPQ8N4V2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SVOPQ8N4V2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SVOPQ8N4V2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SVOPQ8N4V2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SVOPQ8N4V2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SVOPQ8N4V2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SVOPQ8N4V2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SVOPQ8N4V2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SVOPQ8N4V2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SVOPQ8N4V2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SVOPQ8N4V2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SVOPQ8N4V2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SVOPQ8N4V2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SVOPQ8N4V2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SVOPQ8N4V2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SVOPQ8N4V2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SVOPQ8N4V2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SVOPQ8N4V2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SVOPQ8N4V2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SVOPQ8N4V2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SVOPQ8N4V2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SVOPQ8N4V2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SVOPQ8N4V2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SVOPQ8N4V2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SVOPQ8N4V2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SVOPQ8N4V2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SVOPQ8N4V2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SVOPQ8N4V2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SVOPQ8N4V2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SVOPQ8N4V2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SVOPQ8N4V2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SVOPQ8N4V2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SVOPQ8N4V2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SVOPQ8N4V2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SVOPQ8N4V2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SVOPQ8N4V2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SVOPQ8N4V2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SVOPQ8N4V2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SVOPQ8N4V2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SVOPQ8N4V2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SVOPQ8N4V2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SVOPQ8N4V2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SVOPQ8N4V2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SVOPQ8N4V2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SVOPQ8N4V2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SVOPQ8N4V2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SVOPQ8N4V2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SVOPQ8N4V2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SVOPQ8N4V2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SVOPQ8N4V2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SVOPQ8N4V2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SVOPQ8N4V2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SVOPQ8N4V2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SVOPQ8N4V2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SVOPQ8N4V2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SVOPQ8N4V2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SVOPQ8N4V2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SVOPQ8N4V2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SVOPQ8N4V2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SVOPQ8N4V2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms