Protein–RNA interactions for Protein: Q86X55

CARM1, Histone-arginine methyltransferase CARM1, humanhuman

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARM1Q86X55 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CARM1Q86X55 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CARM1Q86X55 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CARM1Q86X55 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CARM1Q86X55 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CARM1Q86X55 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CARM1Q86X55 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CARM1Q86X55 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CARM1Q86X55 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CARM1Q86X55 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CARM1Q86X55 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CARM1Q86X55 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CARM1Q86X55 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CARM1Q86X55 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CARM1Q86X55 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CARM1Q86X55 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CARM1Q86X55 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CARM1Q86X55 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CARM1Q86X55 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CARM1Q86X55 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CARM1Q86X55 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CARM1Q86X55 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CARM1Q86X55 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CARM1Q86X55 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CARM1Q86X55 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CARM1Q86X55 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CARM1Q86X55 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CARM1Q86X55 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CARM1Q86X55 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CARM1Q86X55 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CARM1Q86X55 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CARM1Q86X55 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CARM1Q86X55 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CARM1Q86X55 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CARM1Q86X55 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CARM1Q86X55 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CARM1Q86X55 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CARM1Q86X55 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CARM1Q86X55 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CARM1Q86X55 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CARM1Q86X55 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CARM1Q86X55 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CARM1Q86X55 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CARM1Q86X55 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CARM1Q86X55 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CARM1Q86X55 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CARM1Q86X55 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CARM1Q86X55 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CARM1Q86X55 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CARM1Q86X55 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CARM1Q86X55 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CARM1Q86X55 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CARM1Q86X55 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CARM1Q86X55 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CARM1Q86X55 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CARM1Q86X55 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CARM1Q86X55 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CARM1Q86X55 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CARM1Q86X55 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CARM1Q86X55 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CARM1Q86X55 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CARM1Q86X55 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CARM1Q86X55 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CARM1Q86X55 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CARM1Q86X55 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CARM1Q86X55 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CARM1Q86X55 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CARM1Q86X55 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARM1Q86X55 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARM1Q86X55 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARM1Q86X55 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARM1Q86X55 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CARM1Q86X55 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CARM1Q86X55 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CARM1Q86X55 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CARM1Q86X55 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CARM1Q86X55 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CARM1Q86X55 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CARM1Q86X55 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CARM1Q86X55 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CARM1Q86X55 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CARM1Q86X55 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CARM1Q86X55 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CARM1Q86X55 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CARM1Q86X55 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CARM1Q86X55 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CARM1Q86X55 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CARM1Q86X55 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CARM1Q86X55 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CARM1Q86X55 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CARM1Q86X55 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CARM1Q86X55 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CARM1Q86X55 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CARM1Q86X55 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CARM1Q86X55 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CARM1Q86X55 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CARM1Q86X55 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CARM1Q86X55 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CARM1Q86X55 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CARM1Q86X55 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms