Protein–RNA interactions for Protein: Q86VP3

PACS2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS2Q86VP3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PACS2Q86VP3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PACS2Q86VP3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PACS2Q86VP3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PACS2Q86VP3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PACS2Q86VP3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PACS2Q86VP3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PACS2Q86VP3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PACS2Q86VP3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PACS2Q86VP3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PACS2Q86VP3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PACS2Q86VP3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PACS2Q86VP3 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PACS2Q86VP3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PACS2Q86VP3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PACS2Q86VP3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PACS2Q86VP3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PACS2Q86VP3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PACS2Q86VP3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PACS2Q86VP3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PACS2Q86VP3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PACS2Q86VP3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PACS2Q86VP3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PACS2Q86VP3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PACS2Q86VP3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PACS2Q86VP3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PACS2Q86VP3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PACS2Q86VP3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PACS2Q86VP3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PACS2Q86VP3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PACS2Q86VP3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PACS2Q86VP3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PACS2Q86VP3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PACS2Q86VP3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PACS2Q86VP3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PACS2Q86VP3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PACS2Q86VP3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PACS2Q86VP3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PACS2Q86VP3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PACS2Q86VP3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PACS2Q86VP3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PACS2Q86VP3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PACS2Q86VP3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PACS2Q86VP3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PACS2Q86VP3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PACS2Q86VP3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PACS2Q86VP3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PACS2Q86VP3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PACS2Q86VP3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PACS2Q86VP3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PACS2Q86VP3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PACS2Q86VP3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PACS2Q86VP3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PACS2Q86VP3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PACS2Q86VP3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PACS2Q86VP3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PACS2Q86VP3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PACS2Q86VP3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PACS2Q86VP3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PACS2Q86VP3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PACS2Q86VP3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PACS2Q86VP3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PACS2Q86VP3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PACS2Q86VP3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PACS2Q86VP3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PACS2Q86VP3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PACS2Q86VP3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PACS2Q86VP3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PACS2Q86VP3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PACS2Q86VP3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PACS2Q86VP3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PACS2Q86VP3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PACS2Q86VP3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PACS2Q86VP3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PACS2Q86VP3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PACS2Q86VP3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PACS2Q86VP3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PACS2Q86VP3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PACS2Q86VP3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PACS2Q86VP3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PACS2Q86VP3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PACS2Q86VP3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PACS2Q86VP3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PACS2Q86VP3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PACS2Q86VP3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PACS2Q86VP3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PACS2Q86VP3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PACS2Q86VP3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PACS2Q86VP3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PACS2Q86VP3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PACS2Q86VP3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PACS2Q86VP3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PACS2Q86VP3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PACS2Q86VP3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PACS2Q86VP3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PACS2Q86VP3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PACS2Q86VP3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PACS2Q86VP3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PACS2Q86VP3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PACS2Q86VP3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms