Protein–RNA interactions for Protein: Q71U36

TUBA1A, Tubulin alpha-1A chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1AQ71U36 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBA1AQ71U36 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBA1AQ71U36 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBA1AQ71U36 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBA1AQ71U36 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBA1AQ71U36 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBA1AQ71U36 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBA1AQ71U36 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBA1AQ71U36 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBA1AQ71U36 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBA1AQ71U36 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBA1AQ71U36 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBA1AQ71U36 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBA1AQ71U36 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBA1AQ71U36 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBA1AQ71U36 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBA1AQ71U36 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBA1AQ71U36 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBA1AQ71U36 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBA1AQ71U36 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBA1AQ71U36 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBA1AQ71U36 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBA1AQ71U36 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBA1AQ71U36 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBA1AQ71U36 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBA1AQ71U36 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBA1AQ71U36 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBA1AQ71U36 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBA1AQ71U36 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBA1AQ71U36 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBA1AQ71U36 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBA1AQ71U36 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBA1AQ71U36 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBA1AQ71U36 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBA1AQ71U36 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBA1AQ71U36 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBA1AQ71U36 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBA1AQ71U36 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBA1AQ71U36 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBA1AQ71U36 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBA1AQ71U36 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBA1AQ71U36 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBA1AQ71U36 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBA1AQ71U36 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBA1AQ71U36 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBA1AQ71U36 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBA1AQ71U36 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBA1AQ71U36 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBA1AQ71U36 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBA1AQ71U36 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBA1AQ71U36 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBA1AQ71U36 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBA1AQ71U36 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBA1AQ71U36 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBA1AQ71U36 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBA1AQ71U36 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBA1AQ71U36 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBA1AQ71U36 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBA1AQ71U36 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBA1AQ71U36 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBA1AQ71U36 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBA1AQ71U36 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBA1AQ71U36 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TUBA1AQ71U36 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TUBA1AQ71U36 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBA1AQ71U36 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBA1AQ71U36 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBA1AQ71U36 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBA1AQ71U36 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBA1AQ71U36 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBA1AQ71U36 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBA1AQ71U36 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBA1AQ71U36 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBA1AQ71U36 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBA1AQ71U36 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TUBA1AQ71U36 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBA1AQ71U36 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBA1AQ71U36 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBA1AQ71U36 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBA1AQ71U36 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBA1AQ71U36 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBA1AQ71U36 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBA1AQ71U36 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBA1AQ71U36 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBA1AQ71U36 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TUBA1AQ71U36 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBA1AQ71U36 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBA1AQ71U36 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBA1AQ71U36 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBA1AQ71U36 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBA1AQ71U36 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBA1AQ71U36 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBA1AQ71U36 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBA1AQ71U36 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBA1AQ71U36 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBA1AQ71U36 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBA1AQ71U36 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBA1AQ71U36 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBA1AQ71U36 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBA1AQ71U36 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms