Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP29

PQLC2, Lysosomal amino acid transporter 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PQLC2Q6ZP29 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PQLC2Q6ZP29 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PQLC2Q6ZP29 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PQLC2Q6ZP29 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PQLC2Q6ZP29 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PQLC2Q6ZP29 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PQLC2Q6ZP29 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PQLC2Q6ZP29 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PQLC2Q6ZP29 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PQLC2Q6ZP29 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PQLC2Q6ZP29 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PQLC2Q6ZP29 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PQLC2Q6ZP29 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PQLC2Q6ZP29 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PQLC2Q6ZP29 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PQLC2Q6ZP29 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PQLC2Q6ZP29 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PQLC2Q6ZP29 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PQLC2Q6ZP29 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PQLC2Q6ZP29 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PQLC2Q6ZP29 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PQLC2Q6ZP29 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PQLC2Q6ZP29 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PQLC2Q6ZP29 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PQLC2Q6ZP29 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PQLC2Q6ZP29 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PQLC2Q6ZP29 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PQLC2Q6ZP29 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PQLC2Q6ZP29 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PQLC2Q6ZP29 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PQLC2Q6ZP29 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PQLC2Q6ZP29 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PQLC2Q6ZP29 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PQLC2Q6ZP29 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PQLC2Q6ZP29 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PQLC2Q6ZP29 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PQLC2Q6ZP29 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PQLC2Q6ZP29 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PQLC2Q6ZP29 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PQLC2Q6ZP29 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PQLC2Q6ZP29 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PQLC2Q6ZP29 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PQLC2Q6ZP29 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PQLC2Q6ZP29 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PQLC2Q6ZP29 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PQLC2Q6ZP29 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PQLC2Q6ZP29 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PQLC2Q6ZP29 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PQLC2Q6ZP29 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PQLC2Q6ZP29 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PQLC2Q6ZP29 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PQLC2Q6ZP29 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PQLC2Q6ZP29 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PQLC2Q6ZP29 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PQLC2Q6ZP29 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PQLC2Q6ZP29 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PQLC2Q6ZP29 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PQLC2Q6ZP29 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PQLC2Q6ZP29 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PQLC2Q6ZP29 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PQLC2Q6ZP29 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PQLC2Q6ZP29 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PQLC2Q6ZP29 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PQLC2Q6ZP29 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PQLC2Q6ZP29 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PQLC2Q6ZP29 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PQLC2Q6ZP29 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PQLC2Q6ZP29 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PQLC2Q6ZP29 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PQLC2Q6ZP29 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PQLC2Q6ZP29 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PQLC2Q6ZP29 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PQLC2Q6ZP29 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PQLC2Q6ZP29 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PQLC2Q6ZP29 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PQLC2Q6ZP29 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PQLC2Q6ZP29 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PQLC2Q6ZP29 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PQLC2Q6ZP29 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PQLC2Q6ZP29 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PQLC2Q6ZP29 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PQLC2Q6ZP29 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PQLC2Q6ZP29 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PQLC2Q6ZP29 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PQLC2Q6ZP29 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PQLC2Q6ZP29 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PQLC2Q6ZP29 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PQLC2Q6ZP29 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PQLC2Q6ZP29 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PQLC2Q6ZP29 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PQLC2Q6ZP29 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PQLC2Q6ZP29 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PQLC2Q6ZP29 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PQLC2Q6ZP29 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PQLC2Q6ZP29 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PQLC2Q6ZP29 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PQLC2Q6ZP29 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PQLC2Q6ZP29 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PQLC2Q6ZP29 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PQLC2Q6ZP29 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms