Protein–RNA interactions for Protein: Q6RVD6

SPATA8, Spermatogenesis-associated protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA8Q6RVD6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPATA8Q6RVD6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPATA8Q6RVD6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPATA8Q6RVD6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPATA8Q6RVD6 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPATA8Q6RVD6 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SPATA8Q6RVD6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPATA8Q6RVD6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SPATA8Q6RVD6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPATA8Q6RVD6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPATA8Q6RVD6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPATA8Q6RVD6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPATA8Q6RVD6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPATA8Q6RVD6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPATA8Q6RVD6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPATA8Q6RVD6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPATA8Q6RVD6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPATA8Q6RVD6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPATA8Q6RVD6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPATA8Q6RVD6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SPATA8Q6RVD6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPATA8Q6RVD6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPATA8Q6RVD6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPATA8Q6RVD6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPATA8Q6RVD6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SPATA8Q6RVD6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPATA8Q6RVD6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPATA8Q6RVD6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPATA8Q6RVD6 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPATA8Q6RVD6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPATA8Q6RVD6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPATA8Q6RVD6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPATA8Q6RVD6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPATA8Q6RVD6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPATA8Q6RVD6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPATA8Q6RVD6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPATA8Q6RVD6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPATA8Q6RVD6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPATA8Q6RVD6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPATA8Q6RVD6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPATA8Q6RVD6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPATA8Q6RVD6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPATA8Q6RVD6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPATA8Q6RVD6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SPATA8Q6RVD6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPATA8Q6RVD6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPATA8Q6RVD6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPATA8Q6RVD6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPATA8Q6RVD6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SPATA8Q6RVD6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SPATA8Q6RVD6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPATA8Q6RVD6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SPATA8Q6RVD6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPATA8Q6RVD6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPATA8Q6RVD6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPATA8Q6RVD6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPATA8Q6RVD6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPATA8Q6RVD6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPATA8Q6RVD6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPATA8Q6RVD6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SPATA8Q6RVD6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SPATA8Q6RVD6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SPATA8Q6RVD6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SPATA8Q6RVD6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SPATA8Q6RVD6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SPATA8Q6RVD6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPATA8Q6RVD6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPATA8Q6RVD6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPATA8Q6RVD6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPATA8Q6RVD6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPATA8Q6RVD6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPATA8Q6RVD6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPATA8Q6RVD6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPATA8Q6RVD6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPATA8Q6RVD6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPATA8Q6RVD6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPATA8Q6RVD6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPATA8Q6RVD6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPATA8Q6RVD6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPATA8Q6RVD6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPATA8Q6RVD6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPATA8Q6RVD6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPATA8Q6RVD6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPATA8Q6RVD6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPATA8Q6RVD6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPATA8Q6RVD6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SPATA8Q6RVD6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SPATA8Q6RVD6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SPATA8Q6RVD6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPATA8Q6RVD6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPATA8Q6RVD6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPATA8Q6RVD6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPATA8Q6RVD6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPATA8Q6RVD6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPATA8Q6RVD6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPATA8Q6RVD6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPATA8Q6RVD6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPATA8Q6RVD6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPATA8Q6RVD6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPATA8Q6RVD6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms