Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2H8

TMEM53, Transmembrane protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM53Q6P2H8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM53Q6P2H8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM53Q6P2H8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM53Q6P2H8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM53Q6P2H8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM53Q6P2H8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM53Q6P2H8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM53Q6P2H8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM53Q6P2H8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM53Q6P2H8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM53Q6P2H8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM53Q6P2H8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM53Q6P2H8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM53Q6P2H8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM53Q6P2H8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM53Q6P2H8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM53Q6P2H8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM53Q6P2H8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM53Q6P2H8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM53Q6P2H8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM53Q6P2H8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM53Q6P2H8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM53Q6P2H8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM53Q6P2H8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM53Q6P2H8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM53Q6P2H8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM53Q6P2H8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM53Q6P2H8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM53Q6P2H8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM53Q6P2H8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM53Q6P2H8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM53Q6P2H8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM53Q6P2H8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM53Q6P2H8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM53Q6P2H8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM53Q6P2H8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM53Q6P2H8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM53Q6P2H8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM53Q6P2H8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM53Q6P2H8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM53Q6P2H8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM53Q6P2H8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM53Q6P2H8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM53Q6P2H8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM53Q6P2H8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM53Q6P2H8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM53Q6P2H8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM53Q6P2H8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM53Q6P2H8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM53Q6P2H8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM53Q6P2H8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM53Q6P2H8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM53Q6P2H8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM53Q6P2H8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM53Q6P2H8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM53Q6P2H8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM53Q6P2H8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM53Q6P2H8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM53Q6P2H8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM53Q6P2H8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM53Q6P2H8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM53Q6P2H8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM53Q6P2H8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM53Q6P2H8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM53Q6P2H8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM53Q6P2H8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM53Q6P2H8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM53Q6P2H8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM53Q6P2H8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM53Q6P2H8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM53Q6P2H8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM53Q6P2H8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM53Q6P2H8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM53Q6P2H8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM53Q6P2H8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM53Q6P2H8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM53Q6P2H8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM53Q6P2H8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM53Q6P2H8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM53Q6P2H8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM53Q6P2H8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM53Q6P2H8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM53Q6P2H8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM53Q6P2H8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM53Q6P2H8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM53Q6P2H8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM53Q6P2H8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM53Q6P2H8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM53Q6P2H8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM53Q6P2H8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM53Q6P2H8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM53Q6P2H8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM53Q6P2H8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM53Q6P2H8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM53Q6P2H8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM53Q6P2H8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM53Q6P2H8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM53Q6P2H8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM53Q6P2H8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM53Q6P2H8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.3 ms