Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUJ2

C11orf87, Uncharacterized protein C11orf87, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf87Q6NUJ2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C11orf87Q6NUJ2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
C11orf87Q6NUJ2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
C11orf87Q6NUJ2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C11orf87Q6NUJ2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C11orf87Q6NUJ2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C11orf87Q6NUJ2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C11orf87Q6NUJ2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C11orf87Q6NUJ2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C11orf87Q6NUJ2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C11orf87Q6NUJ2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C11orf87Q6NUJ2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
C11orf87Q6NUJ2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C11orf87Q6NUJ2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C11orf87Q6NUJ2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C11orf87Q6NUJ2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C11orf87Q6NUJ2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C11orf87Q6NUJ2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C11orf87Q6NUJ2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C11orf87Q6NUJ2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C11orf87Q6NUJ2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C11orf87Q6NUJ2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C11orf87Q6NUJ2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C11orf87Q6NUJ2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C11orf87Q6NUJ2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C11orf87Q6NUJ2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
C11orf87Q6NUJ2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C11orf87Q6NUJ2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C11orf87Q6NUJ2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C11orf87Q6NUJ2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C11orf87Q6NUJ2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C11orf87Q6NUJ2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C11orf87Q6NUJ2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C11orf87Q6NUJ2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C11orf87Q6NUJ2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C11orf87Q6NUJ2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C11orf87Q6NUJ2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C11orf87Q6NUJ2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C11orf87Q6NUJ2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C11orf87Q6NUJ2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C11orf87Q6NUJ2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
C11orf87Q6NUJ2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C11orf87Q6NUJ2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
C11orf87Q6NUJ2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C11orf87Q6NUJ2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C11orf87Q6NUJ2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C11orf87Q6NUJ2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C11orf87Q6NUJ2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C11orf87Q6NUJ2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C11orf87Q6NUJ2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C11orf87Q6NUJ2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C11orf87Q6NUJ2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C11orf87Q6NUJ2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C11orf87Q6NUJ2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
C11orf87Q6NUJ2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C11orf87Q6NUJ2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C11orf87Q6NUJ2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C11orf87Q6NUJ2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C11orf87Q6NUJ2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C11orf87Q6NUJ2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C11orf87Q6NUJ2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C11orf87Q6NUJ2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C11orf87Q6NUJ2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C11orf87Q6NUJ2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C11orf87Q6NUJ2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C11orf87Q6NUJ2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C11orf87Q6NUJ2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C11orf87Q6NUJ2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C11orf87Q6NUJ2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C11orf87Q6NUJ2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C11orf87Q6NUJ2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C11orf87Q6NUJ2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C11orf87Q6NUJ2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C11orf87Q6NUJ2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C11orf87Q6NUJ2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C11orf87Q6NUJ2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C11orf87Q6NUJ2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C11orf87Q6NUJ2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C11orf87Q6NUJ2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C11orf87Q6NUJ2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C11orf87Q6NUJ2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C11orf87Q6NUJ2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C11orf87Q6NUJ2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C11orf87Q6NUJ2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C11orf87Q6NUJ2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C11orf87Q6NUJ2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C11orf87Q6NUJ2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C11orf87Q6NUJ2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C11orf87Q6NUJ2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C11orf87Q6NUJ2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C11orf87Q6NUJ2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C11orf87Q6NUJ2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C11orf87Q6NUJ2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C11orf87Q6NUJ2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C11orf87Q6NUJ2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C11orf87Q6NUJ2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C11orf87Q6NUJ2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C11orf87Q6NUJ2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C11orf87Q6NUJ2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
C11orf87Q6NUJ2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms