Protein–RNA interactions for Protein: Q5ZPR3

CD276, CD276 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD276Q5ZPR3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD276Q5ZPR3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD276Q5ZPR3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD276Q5ZPR3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD276Q5ZPR3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD276Q5ZPR3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD276Q5ZPR3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD276Q5ZPR3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD276Q5ZPR3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CD276Q5ZPR3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD276Q5ZPR3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD276Q5ZPR3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD276Q5ZPR3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CD276Q5ZPR3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD276Q5ZPR3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD276Q5ZPR3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD276Q5ZPR3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD276Q5ZPR3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD276Q5ZPR3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD276Q5ZPR3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD276Q5ZPR3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD276Q5ZPR3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD276Q5ZPR3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD276Q5ZPR3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD276Q5ZPR3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD276Q5ZPR3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD276Q5ZPR3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD276Q5ZPR3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD276Q5ZPR3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD276Q5ZPR3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD276Q5ZPR3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD276Q5ZPR3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD276Q5ZPR3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD276Q5ZPR3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD276Q5ZPR3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CD276Q5ZPR3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD276Q5ZPR3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD276Q5ZPR3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CD276Q5ZPR3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD276Q5ZPR3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD276Q5ZPR3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD276Q5ZPR3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD276Q5ZPR3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD276Q5ZPR3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD276Q5ZPR3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CD276Q5ZPR3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD276Q5ZPR3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD276Q5ZPR3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD276Q5ZPR3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD276Q5ZPR3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CD276Q5ZPR3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD276Q5ZPR3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD276Q5ZPR3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CD276Q5ZPR3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD276Q5ZPR3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD276Q5ZPR3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD276Q5ZPR3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD276Q5ZPR3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD276Q5ZPR3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD276Q5ZPR3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CD276Q5ZPR3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CD276Q5ZPR3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CD276Q5ZPR3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CD276Q5ZPR3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CD276Q5ZPR3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CD276Q5ZPR3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD276Q5ZPR3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD276Q5ZPR3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD276Q5ZPR3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD276Q5ZPR3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD276Q5ZPR3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD276Q5ZPR3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD276Q5ZPR3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD276Q5ZPR3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD276Q5ZPR3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD276Q5ZPR3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD276Q5ZPR3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD276Q5ZPR3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CD276Q5ZPR3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CD276Q5ZPR3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CD276Q5ZPR3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD276Q5ZPR3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD276Q5ZPR3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD276Q5ZPR3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CD276Q5ZPR3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD276Q5ZPR3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD276Q5ZPR3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD276Q5ZPR3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD276Q5ZPR3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD276Q5ZPR3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD276Q5ZPR3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD276Q5ZPR3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD276Q5ZPR3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD276Q5ZPR3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD276Q5ZPR3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD276Q5ZPR3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD276Q5ZPR3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD276Q5ZPR3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD276Q5ZPR3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CD276Q5ZPR3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms