Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TAF3Q5VWG9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TAF3Q5VWG9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TAF3Q5VWG9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TAF3Q5VWG9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TAF3Q5VWG9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TAF3Q5VWG9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TAF3Q5VWG9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TAF3Q5VWG9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TAF3Q5VWG9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TAF3Q5VWG9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TAF3Q5VWG9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TAF3Q5VWG9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TAF3Q5VWG9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TAF3Q5VWG9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TAF3Q5VWG9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TAF3Q5VWG9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TAF3Q5VWG9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TAF3Q5VWG9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TAF3Q5VWG9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
TAF3Q5VWG9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TAF3Q5VWG9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TAF3Q5VWG9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TAF3Q5VWG9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TAF3Q5VWG9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TAF3Q5VWG9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TAF3Q5VWG9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TAF3Q5VWG9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
TAF3Q5VWG9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TAF3Q5VWG9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TAF3Q5VWG9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TAF3Q5VWG9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TAF3Q5VWG9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TAF3Q5VWG9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TAF3Q5VWG9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TAF3Q5VWG9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TAF3Q5VWG9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TAF3Q5VWG9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TAF3Q5VWG9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TAF3Q5VWG9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TAF3Q5VWG9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TAF3Q5VWG9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
TAF3Q5VWG9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TAF3Q5VWG9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TAF3Q5VWG9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TAF3Q5VWG9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TAF3Q5VWG9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TAF3Q5VWG9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TAF3Q5VWG9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TAF3Q5VWG9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TAF3Q5VWG9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TAF3Q5VWG9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TAF3Q5VWG9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TAF3Q5VWG9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TAF3Q5VWG9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TAF3Q5VWG9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TAF3Q5VWG9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TAF3Q5VWG9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TAF3Q5VWG9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
TAF3Q5VWG9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TAF3Q5VWG9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TAF3Q5VWG9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TAF3Q5VWG9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TAF3Q5VWG9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TAF3Q5VWG9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TAF3Q5VWG9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TAF3Q5VWG9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TAF3Q5VWG9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TAF3Q5VWG9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TAF3Q5VWG9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TAF3Q5VWG9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TAF3Q5VWG9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TAF3Q5VWG9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
TAF3Q5VWG9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
TAF3Q5VWG9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TAF3Q5VWG9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TAF3Q5VWG9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TAF3Q5VWG9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TAF3Q5VWG9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TAF3Q5VWG9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TAF3Q5VWG9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TAF3Q5VWG9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TAF3Q5VWG9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TAF3Q5VWG9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TAF3Q5VWG9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TAF3Q5VWG9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TAF3Q5VWG9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TAF3Q5VWG9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TAF3Q5VWG9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TAF3Q5VWG9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TAF3Q5VWG9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TAF3Q5VWG9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TAF3Q5VWG9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TAF3Q5VWG9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TAF3Q5VWG9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TAF3Q5VWG9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TAF3Q5VWG9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TAF3Q5VWG9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TAF3Q5VWG9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TAF3Q5VWG9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms