Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM78BQ5VT40 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM78BQ5VT40 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM78BQ5VT40 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM78BQ5VT40 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM78BQ5VT40 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM78BQ5VT40 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM78BQ5VT40 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM78BQ5VT40 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM78BQ5VT40 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM78BQ5VT40 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM78BQ5VT40 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM78BQ5VT40 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM78BQ5VT40 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM78BQ5VT40 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM78BQ5VT40 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM78BQ5VT40 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM78BQ5VT40 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM78BQ5VT40 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM78BQ5VT40 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM78BQ5VT40 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM78BQ5VT40 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM78BQ5VT40 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM78BQ5VT40 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM78BQ5VT40 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM78BQ5VT40 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM78BQ5VT40 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM78BQ5VT40 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM78BQ5VT40 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM78BQ5VT40 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM78BQ5VT40 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
FAM78BQ5VT40 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
FAM78BQ5VT40 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM78BQ5VT40 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM78BQ5VT40 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM78BQ5VT40 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM78BQ5VT40 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM78BQ5VT40 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM78BQ5VT40 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM78BQ5VT40 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM78BQ5VT40 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM78BQ5VT40 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM78BQ5VT40 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM78BQ5VT40 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM78BQ5VT40 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM78BQ5VT40 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM78BQ5VT40 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM78BQ5VT40 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM78BQ5VT40 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM78BQ5VT40 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM78BQ5VT40 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM78BQ5VT40 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM78BQ5VT40 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM78BQ5VT40 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM78BQ5VT40 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM78BQ5VT40 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM78BQ5VT40 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM78BQ5VT40 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM78BQ5VT40 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM78BQ5VT40 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM78BQ5VT40 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM78BQ5VT40 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM78BQ5VT40 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM78BQ5VT40 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM78BQ5VT40 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM78BQ5VT40 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM78BQ5VT40 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM78BQ5VT40 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM78BQ5VT40 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM78BQ5VT40 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM78BQ5VT40 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM78BQ5VT40 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM78BQ5VT40 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM78BQ5VT40 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM78BQ5VT40 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM78BQ5VT40 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM78BQ5VT40 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM78BQ5VT40 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM78BQ5VT40 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM78BQ5VT40 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM78BQ5VT40 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM78BQ5VT40 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM78BQ5VT40 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM78BQ5VT40 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM78BQ5VT40 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM78BQ5VT40 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM78BQ5VT40 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM78BQ5VT40 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM78BQ5VT40 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM78BQ5VT40 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM78BQ5VT40 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM78BQ5VT40 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM78BQ5VT40 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM78BQ5VT40 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM78BQ5VT40 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM78BQ5VT40 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM78BQ5VT40 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM78BQ5VT40 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM78BQ5VT40 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM78BQ5VT40 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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