Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4D3

TMTC4, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMTC4Q5T4D3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMTC4Q5T4D3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMTC4Q5T4D3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TMTC4Q5T4D3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMTC4Q5T4D3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMTC4Q5T4D3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMTC4Q5T4D3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMTC4Q5T4D3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMTC4Q5T4D3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMTC4Q5T4D3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMTC4Q5T4D3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMTC4Q5T4D3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMTC4Q5T4D3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMTC4Q5T4D3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMTC4Q5T4D3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMTC4Q5T4D3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMTC4Q5T4D3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMTC4Q5T4D3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMTC4Q5T4D3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMTC4Q5T4D3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMTC4Q5T4D3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMTC4Q5T4D3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMTC4Q5T4D3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMTC4Q5T4D3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMTC4Q5T4D3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMTC4Q5T4D3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMTC4Q5T4D3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMTC4Q5T4D3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMTC4Q5T4D3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMTC4Q5T4D3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMTC4Q5T4D3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMTC4Q5T4D3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMTC4Q5T4D3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMTC4Q5T4D3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMTC4Q5T4D3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TMTC4Q5T4D3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMTC4Q5T4D3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMTC4Q5T4D3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMTC4Q5T4D3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMTC4Q5T4D3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMTC4Q5T4D3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TMTC4Q5T4D3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMTC4Q5T4D3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMTC4Q5T4D3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMTC4Q5T4D3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMTC4Q5T4D3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMTC4Q5T4D3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMTC4Q5T4D3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TMTC4Q5T4D3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMTC4Q5T4D3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMTC4Q5T4D3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMTC4Q5T4D3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMTC4Q5T4D3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TMTC4Q5T4D3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMTC4Q5T4D3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMTC4Q5T4D3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMTC4Q5T4D3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMTC4Q5T4D3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMTC4Q5T4D3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMTC4Q5T4D3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMTC4Q5T4D3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMTC4Q5T4D3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMTC4Q5T4D3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMTC4Q5T4D3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMTC4Q5T4D3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMTC4Q5T4D3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMTC4Q5T4D3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMTC4Q5T4D3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMTC4Q5T4D3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMTC4Q5T4D3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMTC4Q5T4D3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMTC4Q5T4D3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMTC4Q5T4D3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TMTC4Q5T4D3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMTC4Q5T4D3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMTC4Q5T4D3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMTC4Q5T4D3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMTC4Q5T4D3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMTC4Q5T4D3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMTC4Q5T4D3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMTC4Q5T4D3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMTC4Q5T4D3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMTC4Q5T4D3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMTC4Q5T4D3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMTC4Q5T4D3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMTC4Q5T4D3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMTC4Q5T4D3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMTC4Q5T4D3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMTC4Q5T4D3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMTC4Q5T4D3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMTC4Q5T4D3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMTC4Q5T4D3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMTC4Q5T4D3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMTC4Q5T4D3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMTC4Q5T4D3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMTC4Q5T4D3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TMTC4Q5T4D3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMTC4Q5T4D3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMTC4Q5T4D3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMTC4Q5T4D3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms