Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2D3

OTUD3, OTU domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD3Q5T2D3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
OTUD3Q5T2D3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
OTUD3Q5T2D3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
OTUD3Q5T2D3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
OTUD3Q5T2D3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
OTUD3Q5T2D3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
OTUD3Q5T2D3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
OTUD3Q5T2D3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
OTUD3Q5T2D3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
OTUD3Q5T2D3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
OTUD3Q5T2D3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
OTUD3Q5T2D3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
OTUD3Q5T2D3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
OTUD3Q5T2D3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
OTUD3Q5T2D3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
OTUD3Q5T2D3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
OTUD3Q5T2D3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
OTUD3Q5T2D3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
OTUD3Q5T2D3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
OTUD3Q5T2D3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
OTUD3Q5T2D3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
OTUD3Q5T2D3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
OTUD3Q5T2D3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
OTUD3Q5T2D3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
OTUD3Q5T2D3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
OTUD3Q5T2D3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
OTUD3Q5T2D3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
OTUD3Q5T2D3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
OTUD3Q5T2D3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
OTUD3Q5T2D3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
OTUD3Q5T2D3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
OTUD3Q5T2D3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
OTUD3Q5T2D3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
OTUD3Q5T2D3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
OTUD3Q5T2D3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
OTUD3Q5T2D3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
OTUD3Q5T2D3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
OTUD3Q5T2D3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
OTUD3Q5T2D3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
OTUD3Q5T2D3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
OTUD3Q5T2D3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
OTUD3Q5T2D3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
OTUD3Q5T2D3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
OTUD3Q5T2D3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
OTUD3Q5T2D3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
OTUD3Q5T2D3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
OTUD3Q5T2D3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
OTUD3Q5T2D3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
OTUD3Q5T2D3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
OTUD3Q5T2D3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
OTUD3Q5T2D3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
OTUD3Q5T2D3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
OTUD3Q5T2D3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
OTUD3Q5T2D3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
OTUD3Q5T2D3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
OTUD3Q5T2D3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
OTUD3Q5T2D3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
OTUD3Q5T2D3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
OTUD3Q5T2D3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
OTUD3Q5T2D3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
OTUD3Q5T2D3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
OTUD3Q5T2D3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
OTUD3Q5T2D3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
OTUD3Q5T2D3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
OTUD3Q5T2D3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
OTUD3Q5T2D3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
OTUD3Q5T2D3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
OTUD3Q5T2D3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
OTUD3Q5T2D3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
OTUD3Q5T2D3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
OTUD3Q5T2D3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
OTUD3Q5T2D3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
OTUD3Q5T2D3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
OTUD3Q5T2D3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
OTUD3Q5T2D3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
OTUD3Q5T2D3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
OTUD3Q5T2D3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
OTUD3Q5T2D3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
OTUD3Q5T2D3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
OTUD3Q5T2D3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
OTUD3Q5T2D3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
OTUD3Q5T2D3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
OTUD3Q5T2D3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
OTUD3Q5T2D3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
OTUD3Q5T2D3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
OTUD3Q5T2D3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
OTUD3Q5T2D3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
OTUD3Q5T2D3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
OTUD3Q5T2D3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
OTUD3Q5T2D3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
OTUD3Q5T2D3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
OTUD3Q5T2D3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
OTUD3Q5T2D3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
OTUD3Q5T2D3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
OTUD3Q5T2D3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
OTUD3Q5T2D3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
OTUD3Q5T2D3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
OTUD3Q5T2D3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
OTUD3Q5T2D3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
OTUD3Q5T2D3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms