Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCM7

TUBB8, Tubulin beta-8 chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB8Q3ZCM7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
TUBB8Q3ZCM7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TUBB8Q3ZCM7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TUBB8Q3ZCM7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TUBB8Q3ZCM7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TUBB8Q3ZCM7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TUBB8Q3ZCM7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TUBB8Q3ZCM7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TUBB8Q3ZCM7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TUBB8Q3ZCM7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TUBB8Q3ZCM7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TUBB8Q3ZCM7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TUBB8Q3ZCM7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TUBB8Q3ZCM7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TUBB8Q3ZCM7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TUBB8Q3ZCM7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TUBB8Q3ZCM7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TUBB8Q3ZCM7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TUBB8Q3ZCM7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TUBB8Q3ZCM7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TUBB8Q3ZCM7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TUBB8Q3ZCM7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TUBB8Q3ZCM7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TUBB8Q3ZCM7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TUBB8Q3ZCM7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TUBB8Q3ZCM7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TUBB8Q3ZCM7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TUBB8Q3ZCM7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TUBB8Q3ZCM7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TUBB8Q3ZCM7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TUBB8Q3ZCM7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TUBB8Q3ZCM7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TUBB8Q3ZCM7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TUBB8Q3ZCM7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TUBB8Q3ZCM7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TUBB8Q3ZCM7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TUBB8Q3ZCM7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TUBB8Q3ZCM7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TUBB8Q3ZCM7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TUBB8Q3ZCM7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TUBB8Q3ZCM7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TUBB8Q3ZCM7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TUBB8Q3ZCM7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TUBB8Q3ZCM7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TUBB8Q3ZCM7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TUBB8Q3ZCM7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TUBB8Q3ZCM7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TUBB8Q3ZCM7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TUBB8Q3ZCM7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TUBB8Q3ZCM7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TUBB8Q3ZCM7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TUBB8Q3ZCM7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TUBB8Q3ZCM7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TUBB8Q3ZCM7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TUBB8Q3ZCM7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TUBB8Q3ZCM7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TUBB8Q3ZCM7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TUBB8Q3ZCM7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TUBB8Q3ZCM7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TUBB8Q3ZCM7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TUBB8Q3ZCM7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TUBB8Q3ZCM7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TUBB8Q3ZCM7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TUBB8Q3ZCM7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TUBB8Q3ZCM7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TUBB8Q3ZCM7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TUBB8Q3ZCM7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TUBB8Q3ZCM7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TUBB8Q3ZCM7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TUBB8Q3ZCM7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TUBB8Q3ZCM7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TUBB8Q3ZCM7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TUBB8Q3ZCM7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TUBB8Q3ZCM7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TUBB8Q3ZCM7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TUBB8Q3ZCM7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TUBB8Q3ZCM7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TUBB8Q3ZCM7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TUBB8Q3ZCM7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TUBB8Q3ZCM7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TUBB8Q3ZCM7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TUBB8Q3ZCM7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TUBB8Q3ZCM7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TUBB8Q3ZCM7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TUBB8Q3ZCM7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TUBB8Q3ZCM7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TUBB8Q3ZCM7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TUBB8Q3ZCM7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TUBB8Q3ZCM7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TUBB8Q3ZCM7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TUBB8Q3ZCM7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TUBB8Q3ZCM7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TUBB8Q3ZCM7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TUBB8Q3ZCM7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TUBB8Q3ZCM7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TUBB8Q3ZCM7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TUBB8Q3ZCM7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TUBB8Q3ZCM7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TUBB8Q3ZCM7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TUBB8Q3ZCM7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms