Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI77

KRTAP13-4, Keratin-associated protein 13-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-4Q3LI77 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP13-4Q3LI77 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP13-4Q3LI77 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP13-4Q3LI77 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP13-4Q3LI77 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP13-4Q3LI77 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP13-4Q3LI77 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP13-4Q3LI77 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP13-4Q3LI77 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP13-4Q3LI77 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP13-4Q3LI77 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP13-4Q3LI77 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP13-4Q3LI77 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP13-4Q3LI77 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP13-4Q3LI77 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP13-4Q3LI77 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
KRTAP13-4Q3LI77 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
KRTAP13-4Q3LI77 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP13-4Q3LI77 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP13-4Q3LI77 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP13-4Q3LI77 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP13-4Q3LI77 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KRTAP13-4Q3LI77 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KRTAP13-4Q3LI77 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KRTAP13-4Q3LI77 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KRTAP13-4Q3LI77 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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KRTAP13-4Q3LI77 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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KRTAP13-4Q3LI77 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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KRTAP13-4Q3LI77 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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KRTAP13-4Q3LI77 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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KRTAP13-4Q3LI77 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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KRTAP13-4Q3LI77 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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KRTAP13-4Q3LI77 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KRTAP13-4Q3LI77 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KRTAP13-4Q3LI77 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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KRTAP13-4Q3LI77 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KRTAP13-4Q3LI77 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KRTAP13-4Q3LI77 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KRTAP13-4Q3LI77 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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KRTAP13-4Q3LI77 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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KRTAP13-4Q3LI77 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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KRTAP13-4Q3LI77 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
KRTAP13-4Q3LI77 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
KRTAP13-4Q3LI77 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
KRTAP13-4Q3LI77 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
KRTAP13-4Q3LI77 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
KRTAP13-4Q3LI77 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
KRTAP13-4Q3LI77 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
KRTAP13-4Q3LI77 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
KRTAP13-4Q3LI77 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
KRTAP13-4Q3LI77 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
KRTAP13-4Q3LI77 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
KRTAP13-4Q3LI77 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
KRTAP13-4Q3LI77 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
KRTAP13-4Q3LI77 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
KRTAP13-4Q3LI77 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
KRTAP13-4Q3LI77 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
KRTAP13-4Q3LI77 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP13-4Q3LI77 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP13-4Q3LI77 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP13-4Q3LI77 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP13-4Q3LI77 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP13-4Q3LI77 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP13-4Q3LI77 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP13-4Q3LI77 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP13-4Q3LI77 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP13-4Q3LI77 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP13-4Q3LI77 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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