Protein–RNA interactions for Protein: Q2MJR0

SPRED3, Sprouty-related, EVH1 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRED3Q2MJR0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPRED3Q2MJR0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPRED3Q2MJR0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPRED3Q2MJR0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPRED3Q2MJR0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPRED3Q2MJR0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPRED3Q2MJR0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SPRED3Q2MJR0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPRED3Q2MJR0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPRED3Q2MJR0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPRED3Q2MJR0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPRED3Q2MJR0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPRED3Q2MJR0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPRED3Q2MJR0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPRED3Q2MJR0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPRED3Q2MJR0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPRED3Q2MJR0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPRED3Q2MJR0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPRED3Q2MJR0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPRED3Q2MJR0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPRED3Q2MJR0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPRED3Q2MJR0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SPRED3Q2MJR0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
SPRED3Q2MJR0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPRED3Q2MJR0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPRED3Q2MJR0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPRED3Q2MJR0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPRED3Q2MJR0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPRED3Q2MJR0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPRED3Q2MJR0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPRED3Q2MJR0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SPRED3Q2MJR0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SPRED3Q2MJR0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPRED3Q2MJR0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPRED3Q2MJR0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPRED3Q2MJR0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPRED3Q2MJR0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPRED3Q2MJR0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SPRED3Q2MJR0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPRED3Q2MJR0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SPRED3Q2MJR0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SPRED3Q2MJR0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SPRED3Q2MJR0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SPRED3Q2MJR0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SPRED3Q2MJR0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SPRED3Q2MJR0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SPRED3Q2MJR0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
SPRED3Q2MJR0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPRED3Q2MJR0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPRED3Q2MJR0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPRED3Q2MJR0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPRED3Q2MJR0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPRED3Q2MJR0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPRED3Q2MJR0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPRED3Q2MJR0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPRED3Q2MJR0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SPRED3Q2MJR0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SPRED3Q2MJR0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPRED3Q2MJR0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SPRED3Q2MJR0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPRED3Q2MJR0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPRED3Q2MJR0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPRED3Q2MJR0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPRED3Q2MJR0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPRED3Q2MJR0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPRED3Q2MJR0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPRED3Q2MJR0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPRED3Q2MJR0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPRED3Q2MJR0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPRED3Q2MJR0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPRED3Q2MJR0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPRED3Q2MJR0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPRED3Q2MJR0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPRED3Q2MJR0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPRED3Q2MJR0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPRED3Q2MJR0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPRED3Q2MJR0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SPRED3Q2MJR0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPRED3Q2MJR0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPRED3Q2MJR0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPRED3Q2MJR0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPRED3Q2MJR0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPRED3Q2MJR0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPRED3Q2MJR0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPRED3Q2MJR0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPRED3Q2MJR0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPRED3Q2MJR0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPRED3Q2MJR0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPRED3Q2MJR0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPRED3Q2MJR0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPRED3Q2MJR0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPRED3Q2MJR0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPRED3Q2MJR0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPRED3Q2MJR0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPRED3Q2MJR0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPRED3Q2MJR0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPRED3Q2MJR0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPRED3Q2MJR0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPRED3Q2MJR0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPRED3Q2MJR0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms