Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.144e-8■■■■■ 43.4
ILF3Q12906 JMJD1C-207ENST00000489372 913 ntTSL 55.69□□□□□ -1.54e-8■■■■■ 43.4
ILF3Q12906 JMJD1C-205ENST00000469152 734 ntTSL 34.68□□□□□ -1.664e-8■■■■■ 43.4
ILF3Q12906 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.874e-8■■■■■ 43.4
ILF3Q12906 JMJD1C-203ENST00000402544 8011 ntTSL 1 (best)2.88□□□□□ -1.954e-8■■■■■ 43.4
ILF3Q12906 BCL2L1-208ENST00000450273 894 ntTSL 318.11■□□□□ 0.495e-8■■■■■ 43.3
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ILF3Q12906 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.415e-8■■■■■ 43.3
ILF3Q12906 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.465e-8■■■■■ 43.3
ILF3Q12906 GTF2IP13-202ENST00000609439 10247 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.514e-24■■■■■ 43.3
ILF3Q12906 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.032e-11■■■■■ 42.8
ILF3Q12906 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.212e-11■■■■■ 42.8
ILF3Q12906 AC087633.2-207ENST00000616940 698 ntTSL 54.15□□□□□ -1.751e-8■■■■■ 42.6
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ILF3Q12906 TMEM63A-201ENST00000366835 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.742e-12■■■■■ 42.2
ILF3Q12906 HNF4A-AS1-201ENST00000452481 648 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.752e-12■■■■■ 42.2
ILF3Q12906 RAF1-203ENST00000423275 2354 ntTSL 217.32■□□□□ 0.364e-13■■■■■ 42.1
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ILF3Q12906 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.314e-13■■■■■ 42.1
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ILF3Q12906 RAF1-204ENST00000432427 1831 ntTSL 58.12□□□□□ -1.114e-13■■■■■ 42.1
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ILF3Q12906 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 14e-12■■■■■ 41.4
ILF3Q12906 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.384e-12■■■■■ 41.4
ILF3Q12906 BTBD2-207ENST00000589685 2422 ntTSL 1 (best)17.11■□□□□ 0.334e-12■■■■■ 41.4
ILF3Q12906 BTBD2-209ENST00000592082 349 ntTSL 515.3■□□□□ 0.044e-12■■■■■ 41.4
ILF3Q12906 ITGB5-208ENST00000483168 576 ntTSL 414.84□□□□□ -0.034e-12■■■■■ 41.4
ILF3Q12906 ITGB5-204ENST00000465464 1164 ntTSL 512.27□□□□□ -0.454e-12■■■■■ 41.4
ILF3Q12906 BTBD2-204ENST00000587825 961 ntTSL 512.25□□□□□ -0.454e-12■■■■■ 41.4
ILF3Q12906 MYO18A-209ENST00000531253 7504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.664e-12■■■■■ 41.4
ILF3Q12906 MYO18A-223ENST00000628822 7501 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.674e-12■■■■■ 41.4
ILF3Q12906 MYO18A-202ENST00000527372 9992 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.74e-12■■■■■ 41.4
ILF3Q12906 MYO18A-214ENST00000533112 7522 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.754e-12■■■■■ 41.4
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ILF3Q12906 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.424e-7■■■■■ 41.2
ILF3Q12906 SCARB1-205ENST00000538291 5527 ntTSL 516.79■□□□□ 0.284e-7■■■■■ 41.2
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ILF3Q12906 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.074e-7■■■■■ 41.2
ILF3Q12906 SCARB1-204ENST00000535005 1845 ntTSL 1 (best)12□□□□□ -0.494e-7■■■■■ 41.2
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ILF3Q12906 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.13e-10■■■■■ 41.2
ILF3Q12906 ZFPM2-205ENST00000520027 594 ntTSL 45.9□□□□□ -1.463e-10■■■■■ 41.2
ILF3Q12906 ZFPM2-210ENST00000524235 574 ntTSL 44.95□□□□□ -1.623e-10■■■■■ 41.2
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ILF3Q12906 PROCA1-207ENST00000578097 527 ntTSL 415.96■□□□□ 0.152e-11■■■■■ 40.6
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ILF3Q12906 PROCA1-209ENST00000581289 766 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.842e-11■■■■■ 40.6
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ILF3Q12906 FTO-212ENST00000636030 1636 ntTSL 59.15□□□□□ -0.947e-12■■■■■ 40.6
ILF3Q12906 FTO-216ENST00000636992 1514 ntTSL 59.04□□□□□ -0.967e-12■■■■■ 40.6
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ILF3Q12906 FTO-220ENST00000637562 1524 ntTSL 58.54□□□□□ -1.047e-12■■■■■ 40.6
ILF3Q12906 FTO-222ENST00000637969 2889 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.117e-12■■■■■ 40.6
ILF3Q12906 INPP5B-205ENST00000373027 3905 ntTSL 2 BASIC8.11□□□□□ -1.117e-12■■■■■ 40.6
ILF3Q12906 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.247e-12■■■■■ 40.6
ILF3Q12906 FTO-208ENST00000563011 2015 ntTSL 57.19□□□□□ -1.267e-12■■■■■ 40.6
ILF3Q12906 FTO-205ENST00000464071 1065 ntTSL 26.54□□□□□ -1.367e-12■■■■■ 40.6
ILF3Q12906 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.427e-12■■■■■ 40.6
ILF3Q12906 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.447e-12■■■■■ 40.6
ILF3Q12906 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.457e-12■■■■■ 40.6
ILF3Q12906 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.527e-12■■■■■ 40.6
ILF3Q12906 FTO-211ENST00000635892 1085 ntTSL 55.4□□□□□ -1.547e-12■■■■■ 40.6
ILF3Q12906 FTO-201ENST00000268349 2799 ntTSL 1 (best)4.87□□□□□ -1.637e-12■■■■■ 40.6
ILF3Q12906 SMC4-221ENST00000489573 1553 ntTSL 1 (best)21.02■□□□□ 0.968e-14■■■■■ 40.3
ILF3Q12906 SMC4-209ENST00000468653 1756 ntTSL 218.32■□□□□ 0.528e-14■■■■■ 40.3
ILF3Q12906 SMC4-211ENST00000469858 1971 ntTSL 217.46■□□□□ 0.398e-14■■■■■ 40.3
ILF3Q12906 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.348e-14■■■■■ 40.3
ILF3Q12906 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.028e-14■■■■■ 40.3
ILF3Q12906 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.398e-14■■■■■ 40.3
ILF3Q12906 SMC4-210ENST00000469762 3998 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.918e-14■■■■■ 40.3
ILF3Q12906 SMC4-213ENST00000472282 667 ntTSL 38.97□□□□□ -0.978e-14■■■■■ 40.3
ILF3Q12906 SMC4-214ENST00000472991 582 ntTSL 58.96□□□□□ -0.988e-14■■■■■ 40.3
ILF3Q12906 SMC4-212ENST00000470240 724 ntTSL 37.48□□□□□ -1.218e-14■■■■■ 40.3
ILF3Q12906 SMC4-219ENST00000487747 637 ntTSL 54.5□□□□□ -1.698e-14■■■■■ 40.3
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