Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.144e-8■■■■■ 43.4
ILF3Q12906 JMJD1C-207ENST00000489372 913 ntTSL 55.69□□□□□ -1.54e-8■■■■■ 43.4
ILF3Q12906 JMJD1C-205ENST00000469152 734 ntTSL 34.68□□□□□ -1.664e-8■■■■■ 43.4
ILF3Q12906 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.874e-8■■■■■ 43.4
ILF3Q12906 JMJD1C-203ENST00000402544 8011 ntTSL 1 (best)2.88□□□□□ -1.954e-8■■■■■ 43.4
ILF3Q12906 BCL2L1-208ENST00000450273 894 ntTSL 318.11■□□□□ 0.495e-8■■■■■ 43.3
ILF3Q12906 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.415e-8■■■■■ 43.3
ILF3Q12906 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.415e-8■■■■■ 43.3
ILF3Q12906 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.465e-8■■■■■ 43.3
ILF3Q12906 GTF2IP13-202ENST00000609439 10247 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.514e-24■■■■■ 43.3
ILF3Q12906 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.032e-11■■■■■ 42.8
ILF3Q12906 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.212e-11■■■■■ 42.8
ILF3Q12906 AC087633.2-207ENST00000616940 698 ntTSL 54.15□□□□□ -1.751e-8■■■■■ 42.6
ILF3Q12906 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.014e-8■■■■■ 42.4
ILF3Q12906 RCL1-206ENST00000442869 1644 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.414e-8■■■■■ 42.4
ILF3Q12906 RCL1-203ENST00000381732 804 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.594e-8■■■■■ 42.4
ILF3Q12906 RCL1-209ENST00000473230 441 ntTSL 36.73□□□□□ -1.334e-8■■■■■ 42.4
ILF3Q12906 PFKFB4-214ENST00000490404 849 ntTSL 39.57□□□□□ -0.883e-12■■■■■ 42.2
ILF3Q12906 TMEM63A-201ENST00000366835 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.742e-12■■■■■ 42.2
ILF3Q12906 HNF4A-AS1-201ENST00000452481 648 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.752e-12■■■■■ 42.2
ILF3Q12906 RAF1-203ENST00000423275 2354 ntTSL 217.32■□□□□ 0.364e-13■■■■■ 42.1
ILF3Q12906 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.164e-13■■■■■ 42.1
ILF3Q12906 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.314e-13■■■■■ 42.1
ILF3Q12906 RAF1-207ENST00000465826 1518 ntTSL 310.48□□□□□ -0.734e-13■■■■■ 42.1
ILF3Q12906 RAF1-204ENST00000432427 1831 ntTSL 58.12□□□□□ -1.114e-13■■■■■ 42.1
ILF3Q12906 RAF1-206ENST00000460610 484 ntTSL 37.07□□□□□ -1.284e-13■■■■■ 42.1
ILF3Q12906 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 14e-12■■■■■ 41.4
ILF3Q12906 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.384e-12■■■■■ 41.4
ILF3Q12906 BTBD2-207ENST00000589685 2422 ntTSL 1 (best)17.11■□□□□ 0.334e-12■■■■■ 41.4
ILF3Q12906 BTBD2-209ENST00000592082 349 ntTSL 515.3■□□□□ 0.044e-12■■■■■ 41.4
ILF3Q12906 ITGB5-208ENST00000483168 576 ntTSL 414.84□□□□□ -0.034e-12■■■■■ 41.4
ILF3Q12906 ITGB5-204ENST00000465464 1164 ntTSL 512.27□□□□□ -0.454e-12■■■■■ 41.4
ILF3Q12906 BTBD2-204ENST00000587825 961 ntTSL 512.25□□□□□ -0.454e-12■■■■■ 41.4
ILF3Q12906 MYO18A-209ENST00000531253 7504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.664e-12■■■■■ 41.4
ILF3Q12906 MYO18A-223ENST00000628822 7501 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.674e-12■■■■■ 41.4
ILF3Q12906 MYO18A-202ENST00000527372 9992 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.74e-12■■■■■ 41.4
ILF3Q12906 MYO18A-214ENST00000533112 7522 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.754e-12■■■■■ 41.4
ILF3Q12906 ITGB5-211ENST00000608107 548 ntTSL 310.05□□□□□ -0.84e-12■■■■■ 41.4
ILF3Q12906 ITGB5-212ENST00000608657 825 ntTSL 38.73□□□□□ -1.014e-12■■■■■ 41.4
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ILF3Q12906 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.874e-7■■■■■ 41.2
ILF3Q12906 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.424e-7■■■■■ 41.2
ILF3Q12906 SCARB1-205ENST00000538291 5527 ntTSL 516.79■□□□□ 0.284e-7■■■■■ 41.2
ILF3Q12906 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.234e-7■■■■■ 41.2
ILF3Q12906 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.074e-7■■■■■ 41.2
ILF3Q12906 SCARB1-204ENST00000535005 1845 ntTSL 1 (best)12□□□□□ -0.494e-7■■■■■ 41.2
ILF3Q12906 ZFPM2-202ENST00000511341 1582 ntTSL 1 (best)19.4■□□□□ 0.73e-10■■■■■ 41.2
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ILF3Q12906 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.13e-10■■■■■ 41.2
ILF3Q12906 ZFPM2-205ENST00000520027 594 ntTSL 45.9□□□□□ -1.463e-10■■■■■ 41.2
ILF3Q12906 ZFPM2-210ENST00000524235 574 ntTSL 44.95□□□□□ -1.623e-10■■■■■ 41.2
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ILF3Q12906 FANCA-227ENST00000567883 650 ntTSL 211.08□□□□□ -0.641e-7■■■■■ 41
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ILF3Q12906 PRICKLE3-202ENST00000376317 574 ntTSL 420.13■□□□□ 0.811e-10■■■■■ 40.8
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ILF3Q12906 PRICKLE3-205ENST00000540849 2246 ntTSL 212.15□□□□□ -0.461e-10■■■■■ 40.8
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ILF3Q12906 PROCA1-204ENST00000439862 1137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.682e-11■■■■■ 40.6
ILF3Q12906 PROCA1-209ENST00000581289 766 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.842e-11■■■■■ 40.6
ILF3Q12906 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.037e-12■■■■■ 40.6
ILF3Q12906 INPP5B-206ENST00000458109 3979 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.827e-12■■■■■ 40.6
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ILF3Q12906 FTO-212ENST00000636030 1636 ntTSL 59.15□□□□□ -0.947e-12■■■■■ 40.6
ILF3Q12906 FTO-216ENST00000636992 1514 ntTSL 59.04□□□□□ -0.967e-12■■■■■ 40.6
ILF3Q12906 FTO-221ENST00000637845 2472 ntTSL 58.87□□□□□ -0.997e-12■■■■■ 40.6
ILF3Q12906 FTO-220ENST00000637562 1524 ntTSL 58.54□□□□□ -1.047e-12■■■■■ 40.6
ILF3Q12906 FTO-222ENST00000637969 2889 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.117e-12■■■■■ 40.6
ILF3Q12906 INPP5B-205ENST00000373027 3905 ntTSL 2 BASIC8.11□□□□□ -1.117e-12■■■■■ 40.6
ILF3Q12906 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.247e-12■■■■■ 40.6
ILF3Q12906 FTO-208ENST00000563011 2015 ntTSL 57.19□□□□□ -1.267e-12■■■■■ 40.6
ILF3Q12906 FTO-205ENST00000464071 1065 ntTSL 26.54□□□□□ -1.367e-12■■■■■ 40.6
ILF3Q12906 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.427e-12■■■■■ 40.6
ILF3Q12906 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.447e-12■■■■■ 40.6
ILF3Q12906 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.457e-12■■■■■ 40.6
ILF3Q12906 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.527e-12■■■■■ 40.6
ILF3Q12906 FTO-211ENST00000635892 1085 ntTSL 55.4□□□□□ -1.547e-12■■■■■ 40.6
ILF3Q12906 FTO-201ENST00000268349 2799 ntTSL 1 (best)4.87□□□□□ -1.637e-12■■■■■ 40.6
ILF3Q12906 SMC4-221ENST00000489573 1553 ntTSL 1 (best)21.02■□□□□ 0.968e-14■■■■■ 40.3
ILF3Q12906 SMC4-209ENST00000468653 1756 ntTSL 218.32■□□□□ 0.528e-14■■■■■ 40.3
ILF3Q12906 SMC4-211ENST00000469858 1971 ntTSL 217.46■□□□□ 0.398e-14■■■■■ 40.3
ILF3Q12906 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.348e-14■■■■■ 40.3
ILF3Q12906 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.028e-14■■■■■ 40.3
ILF3Q12906 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.398e-14■■■■■ 40.3
ILF3Q12906 SMC4-210ENST00000469762 3998 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.918e-14■■■■■ 40.3
ILF3Q12906 SMC4-213ENST00000472282 667 ntTSL 38.97□□□□□ -0.978e-14■■■■■ 40.3
ILF3Q12906 SMC4-214ENST00000472991 582 ntTSL 58.96□□□□□ -0.988e-14■■■■■ 40.3
ILF3Q12906 SMC4-212ENST00000470240 724 ntTSL 37.48□□□□□ -1.218e-14■■■■■ 40.3
ILF3Q12906 SMC4-219ENST00000487747 637 ntTSL 54.5□□□□□ -1.698e-14■■■■■ 40.3
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