Protein–RNA interactions for Protein: Q12306

SMT3, Ubiquitin-like protein SMT3, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SMT3Q12306 BNA2YJR078W 1362 nt8.61□□□□□ -1.03
SMT3Q12306 CYT2YKL087C 675 nt8.6□□□□□ -1.03
SMT3Q12306 MXR2YCL033C 507 nt8.6□□□□□ -1.03
SMT3Q12306 SNF1YDR477W 1902 nt8.6□□□□□ -1.03
SMT3Q12306 FMP45YDL222C 930 nt8.59□□□□□ -1.03
SMT3Q12306 IRC24YIR036C 792 nt8.59□□□□□ -1.03
SMT3Q12306 GAL1YBR020W 1587 nt8.59□□□□□ -1.03
SMT3Q12306 PBP1YGR178C 2169 nt8.59□□□□□ -1.03
SMT3Q12306 YCL074WYCL074W 927 nt8.58□□□□□ -1.04
SMT3Q12306 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt8.58□□□□□ -1.04
SMT3Q12306 TRM5YHR070W 1500 nt8.58□□□□□ -1.04
SMT3Q12306 YGR259CYGR259C 441 nt8.57□□□□□ -1.04
SMT3Q12306 MIC12YBR262C 321 nt8.56□□□□□ -1.04
SMT3Q12306 FRD1YEL047C 1413 nt8.55□□□□□ -1.04
SMT3Q12306 ANP1YEL036C 1503 nt8.55□□□□□ -1.04
SMT3Q12306 DUS1YML080W 1272 nt8.54□□□□□ -1.04
SMT3Q12306 AQY1YPR192W 918 nt8.54□□□□□ -1.04
SMT3Q12306 ERV46YAL042W 1248 nt8.53□□□□□ -1.04
SMT3Q12306 DIC1YLR348C 897 nt8.53□□□□□ -1.04
SMT3Q12306 YKR040CYKR040C 504 nt8.52□□□□□ -1.05
SMT3Q12306 PUS2YGL063W 1113 nt8.51□□□□□ -1.05
SMT3Q12306 AGP1YCL025C 1902 nt8.5□□□□□ -1.05
SMT3Q12306 CMP2YML057W 1815 nt8.45□□□□□ -1.06
SMT3Q12306 HHO1YPL127C 777 nt8.45□□□□□ -1.06
SMT3Q12306 SPC25YER018C 666 nt8.44□□□□□ -1.06
SMT3Q12306 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt8.43□□□□□ -1.06
SMT3Q12306 STB1YNL309W 1263 nt8.43□□□□□ -1.06
SMT3Q12306 LPX1YOR084W 1164 nt8.43□□□□□ -1.06
SMT3Q12306 YPR011CYPR011C 981 nt8.43□□□□□ -1.06
SMT3Q12306 FEN2YCR028C 1539 nt8.43□□□□□ -1.06
SMT3Q12306 YGR201CYGR201C 678 nt8.42□□□□□ -1.06
SMT3Q12306 GPI16YHR188C 1833 nt8.42□□□□□ -1.06
SMT3Q12306 XDJ1YLR090W 1380 nt8.36□□□□□ -1.07
SMT3Q12306 YIR016WYIR016W 798 nt8.36□□□□□ -1.07
SMT3Q12306 RDN18-1RDN18-1 1800 nt8.36□□□□□ -1.07
SMT3Q12306 RDN18-2RDN18-2 1800 nt8.36□□□□□ -1.07
SMT3Q12306 STR3YGL184C 1398 nt8.35□□□□□ -1.07
SMT3Q12306 NDI1YML120C 1542 nt8.35□□□□□ -1.07
SMT3Q12306 RTN2YDL204W 1182 nt8.34□□□□□ -1.07
SMT3Q12306 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt8.34□□□□□ -1.07
SMT3Q12306 IMT4tM(CAU)E 72 nt8.34□□□□□ -1.07
SMT3Q12306 IMT3tM(CAU)J3 72 nt8.34□□□□□ -1.07
SMT3Q12306 IMT1tM(CAU)O1 72 nt8.34□□□□□ -1.07
SMT3Q12306 IMT2tM(CAU)P 72 nt8.34□□□□□ -1.07
SMT3Q12306 VPS60YDR486C 690 nt8.32□□□□□ -1.08
SMT3Q12306 TIM23YNR017W 669 nt8.31□□□□□ -1.08
SMT3Q12306 CCT4YDL143W 1587 nt8.3□□□□□ -1.08
SMT3Q12306 YAT1YAR035W 2064 nt8.3□□□□□ -1.08
SMT3Q12306 YLR179CYLR179C 606 nt8.29□□□□□ -1.08
SMT3Q12306 YLR235CYLR235C 399 nt8.29□□□□□ -1.08
SMT3Q12306 HSL7YBR133C 2484 nt8.28□□□□□ -1.08
SMT3Q12306 AQY2YLL052C 450 nt8.26□□□□□ -1.09
SMT3Q12306 SWC5YBR231C 912 nt8.26□□□□□ -1.09
SMT3Q12306 ALG3YBL082C 1377 nt8.25□□□□□ -1.09
SMT3Q12306 GOR1YNL274C 1053 nt8.25□□□□□ -1.09
SMT3Q12306 AHT1YHR093W 549 nt8.24□□□□□ -1.09
SMT3Q12306 GDH3YAL062W 1374 nt8.23□□□□□ -1.09
SMT3Q12306 DUT1YBR252W 444 nt8.23□□□□□ -1.09
SMT3Q12306 SPT20YOL148C 1815 nt8.23□□□□□ -1.09
SMT3Q12306 PTH1YHR189W 573 nt8.22□□□□□ -1.09
SMT3Q12306 AVT6YER119C 1347 nt8.22□□□□□ -1.09
SMT3Q12306 INA1YLR413W 2028 nt8.18□□□□□ -1.1
SMT3Q12306 YPR064WYPR064W 420 nt8.16□□□□□ -1.1
SMT3Q12306 RDN25-1RDN25-1 3396 nt8.15□□□□□ -1.1
SMT3Q12306 RDN25-2RDN25-2 3396 nt8.15□□□□□ -1.1
SMT3Q12306 RPC82YPR190C 1965 nt8.12□□□□□ -1.11
SMT3Q12306 ALD4YOR374W 1560 nt8.11□□□□□ -1.11
SMT3Q12306 HIF1YLL022C 1158 nt8.11□□□□□ -1.11
SMT3Q12306 YKL030WYKL030W 606 nt8.1□□□□□ -1.11
SMT3Q12306 ARP6YLR085C 1317 nt8.08□□□□□ -1.12
SMT3Q12306 TAD3YLR316C 969 nt8.08□□□□□ -1.12
SMT3Q12306 PLB1YMR008C 1995 nt8.08□□□□□ -1.12
SMT3Q12306 DAT1YML113W 747 nt8.07□□□□□ -1.12
SMT3Q12306 SHM2YLR058C 1410 nt8.04□□□□□ -1.12
SMT3Q12306 PRM5YIL117C 957 nt8.04□□□□□ -1.12
SMT3Q12306 HEL2YDR266C 1920 nt8.03□□□□□ -1.12
SMT3Q12306 TIM17YJL143W 477 nt8.02□□□□□ -1.13
SMT3Q12306 YCR102CYCR102C 1107 nt8.01□□□□□ -1.13
SMT3Q12306 NBP35YGL091C 987 nt8.01□□□□□ -1.13
SMT3Q12306 ZRT3YKL175W 1512 nt8.01□□□□□ -1.13
SMT3Q12306 YLR415CYLR415C 339 nt8□□□□□ -1.13
SMT3Q12306 SPP1YPL138C 1062 nt8□□□□□ -1.13
SMT3Q12306 SAM35YHR083W 990 nt7.98□□□□□ -1.13
SMT3Q12306 BDH1YAL060W 1149 nt7.98□□□□□ -1.13
SMT3Q12306 RIM8YGL045W 1629 nt7.98□□□□□ -1.13
SMT3Q12306 YGL114WYGL114W 2178 nt7.97□□□□□ -1.13
SMT3Q12306 NIT1YIL164C 600 nt7.95□□□□□ -1.14
SMT3Q12306 UTR1YJR049C 1593 nt7.93□□□□□ -1.14
SMT3Q12306 MUP1YGR055W 1725 nt7.92□□□□□ -1.14
SMT3Q12306 LSC2YGR244C 1284 nt7.91□□□□□ -1.14
SMT3Q12306 GAP1YKR039W 1809 nt7.88□□□□□ -1.15
SMT3Q12306 SGT2YOR007C 1041 nt7.88□□□□□ -1.15
SMT3Q12306 HOL1YNR055C 1761 nt7.88□□□□□ -1.15
SMT3Q12306 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt7.86□□□□□ -1.15
SMT3Q12306 TIR3YIL011W 810 nt7.86□□□□□ -1.15
SMT3Q12306 YJL067WYJL067W 351 nt7.86□□□□□ -1.15
SMT3Q12306 YSP3YOR003W 1437 nt7.85□□□□□ -1.15
SMT3Q12306 ILV3YJR016C 1758 nt7.83□□□□□ -1.16
SMT3Q12306 MAE1YKL029C 2010 nt7.81□□□□□ -1.16
SMT3Q12306 DBP1YPL119C 1854 nt7.79□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 24.2 ms