Protein–RNA interactions for Protein: Q12172

YRR1, Zinc finger transcription factor YRR1, yeastyeast

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRR1Q12172 UTP6YDR449C 1323 nt11.8□□□□□ -0.52
YRR1Q12172 PTH1YHR189W 573 nt11.78□□□□□ -0.52
YRR1Q12172 PIB2YGL023C 1908 nt11.76□□□□□ -0.53
YRR1Q12172 LCB1YMR296C 1677 nt11.76□□□□□ -0.53
YRR1Q12172 URH1YDR400W 1023 nt11.76□□□□□ -0.53
YRR1Q12172 YIH1YCR059C 777 nt11.75□□□□□ -0.53
YRR1Q12172 AI3Q0060 1248 nt11.75□□□□□ -0.53
YRR1Q12172 PET20YPL159C 762 nt11.75□□□□□ -0.53
YRR1Q12172 NCP1YHR042W 2076 nt11.74□□□□□ -0.53
YRR1Q12172 YLR235CYLR235C 399 nt11.74□□□□□ -0.53
YRR1Q12172 SIM1YIL123W 1431 nt11.73□□□□□ -0.53
YRR1Q12172 RNQ1YCL028W 1218 nt11.73□□□□□ -0.53
YRR1Q12172 BIO4YNR057C 714 nt11.72□□□□□ -0.53
YRR1Q12172 RTF1YGL244W 1677 nt11.71□□□□□ -0.54
YRR1Q12172 DIC1YLR348C 897 nt11.7□□□□□ -0.54
YRR1Q12172 BOP3YNL042W 1191 nt11.69□□□□□ -0.54
YRR1Q12172 YKL030WYKL030W 606 nt11.67□□□□□ -0.54
YRR1Q12172 AI5_BETAQ0075 1065 nt11.66□□□□□ -0.54
YRR1Q12172 snR78snR78 87 nt11.65□□□□□ -0.54
YRR1Q12172 HUA1YGR268C 597 nt11.65□□□□□ -0.54
YRR1Q12172 SKG1YKR100C 1068 nt11.65□□□□□ -0.54
YRR1Q12172 YLL053CYLL053C 459 nt11.64□□□□□ -0.55
YRR1Q12172 HMT1YBR034C 1047 nt11.63□□□□□ -0.55
YRR1Q12172 TIM23YNR017W 669 nt11.61□□□□□ -0.55
YRR1Q12172 YPL071CYPL071C 471 nt11.6□□□□□ -0.55
YRR1Q12172 SBA1YKL117W 651 nt11.57□□□□□ -0.56
YRR1Q12172 FTR1YER145C 1215 nt11.56□□□□□ -0.56
YRR1Q12172 PTK1YKL198C 1989 nt11.56□□□□□ -0.56
YRR1Q12172 Q0142Q0142 177 nt11.54□□□□□ -0.56
YRR1Q12172 YLR179CYLR179C 606 nt11.54□□□□□ -0.56
YRR1Q12172 ERF2YLR246W 1080 nt11.53□□□□□ -0.56
YRR1Q12172 YNR068CYNR068C 819 nt11.53□□□□□ -0.56
YRR1Q12172 GAL1YBR020W 1587 nt11.53□□□□□ -0.56
YRR1Q12172 LYS4YDR234W 2082 nt11.53□□□□□ -0.56
YRR1Q12172 YJL118WYJL118W 660 nt11.5□□□□□ -0.57
YRR1Q12172 CRR1YLR213C 1269 nt11.5□□□□□ -0.57
YRR1Q12172 ATF2YGR177C 1608 nt11.49□□□□□ -0.57
YRR1Q12172 TRM5YHR070W 1500 nt11.49□□□□□ -0.57
YRR1Q12172 AQY1YPR192W 918 nt11.48□□□□□ -0.57
YRR1Q12172 WSC2YNL283C 1512 nt11.48□□□□□ -0.57
YRR1Q12172 AHT1YHR093W 549 nt11.47□□□□□ -0.57
YRR1Q12172 PAC11YDR488C 1602 nt11.46□□□□□ -0.58
YRR1Q12172 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt11.45□□□□□ -0.58
YRR1Q12172 YFL067WYFL067W 528 nt11.44□□□□□ -0.58
YRR1Q12172 YPR064WYPR064W 420 nt11.44□□□□□ -0.58
YRR1Q12172 YPL168WYPL168W 1293 nt11.43□□□□□ -0.58
YRR1Q12172 YHM2YMR241W 945 nt11.42□□□□□ -0.58
YRR1Q12172 STB1YNL309W 1263 nt11.4□□□□□ -0.58
YRR1Q12172 DDR2YOL052C-A 186 nt11.4□□□□□ -0.58
YRR1Q12172 SPC25YER018C 666 nt11.39□□□□□ -0.59
YRR1Q12172 TAD3YLR316C 969 nt11.39□□□□□ -0.59
YRR1Q12172 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.37□□□□□ -0.59
YRR1Q12172 MIC10YCL057C-A 294 nt11.37□□□□□ -0.59
YRR1Q12172 SNG1YGR197C 1644 nt11.37□□□□□ -0.59
YRR1Q12172 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.36□□□□□ -0.59
YRR1Q12172 HEM12YDR047W 1089 nt11.36□□□□□ -0.59
YRR1Q12172 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.34□□□□□ -0.59
YRR1Q12172 ANP1YEL036C 1503 nt11.34□□□□□ -0.59
YRR1Q12172 URE2YNL229C 1065 nt11.33□□□□□ -0.6
YRR1Q12172 YFL054CYFL054C 1941 nt11.33□□□□□ -0.6
YRR1Q12172 CCT4YDL143W 1587 nt11.31□□□□□ -0.6
YRR1Q12172 GPI16YHR188C 1833 nt11.3□□□□□ -0.6
YRR1Q12172 Q0255Q0255 1419 nt11.3□□□□□ -0.6
YRR1Q12172 VPS60YDR486C 690 nt11.28□□□□□ -0.6
YRR1Q12172 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.28□□□□□ -0.6
YRR1Q12172 FEN2YCR028C 1539 nt11.28□□□□□ -0.6
YRR1Q12172 PAU16YKL224C 372 nt11.25□□□□□ -0.61
YRR1Q12172 BDH1YAL060W 1149 nt11.25□□□□□ -0.61
YRR1Q12172 ALG3YBL082C 1377 nt11.24□□□□□ -0.61
YRR1Q12172 YJL225CYJL225C 5277 nt11.23□□□□□ -0.61
YRR1Q12172 YGL188CYGL188C 174 nt11.23□□□□□ -0.61
YRR1Q12172 YOR169CYOR169C 465 nt11.23□□□□□ -0.61
YRR1Q12172 Q0017Q0017 162 nt11.23□□□□□ -0.61
YRR1Q12172 SPT8YLR055C 1809 nt11.22□□□□□ -0.61
YRR1Q12172 SWC5YBR231C 912 nt11.2□□□□□ -0.62
YRR1Q12172 AIR1YIL079C 1083 nt11.19□□□□□ -0.62
YRR1Q12172 YIR016WYIR016W 798 nt11.19□□□□□ -0.62
YRR1Q12172 YJL107CYJL107C 1164 nt11.19□□□□□ -0.62
YRR1Q12172 YFR018CYFR018C 1092 nt11.18□□□□□ -0.62
YRR1Q12172 YSP3YOR003W 1437 nt11.18□□□□□ -0.62
YRR1Q12172 RAX1YOR301W 1308 nt11.17□□□□□ -0.62
YRR1Q12172 YLR415CYLR415C 339 nt11.17□□□□□ -0.62
YRR1Q12172 THP3YPR045C 1413 nt11.15□□□□□ -0.62
YRR1Q12172 ATP6Q0085 780 nt11.14□□□□□ -0.63
YRR1Q12172 YJR154WYJR154W 1041 nt11.13□□□□□ -0.63
YRR1Q12172 MIC12YBR262C 321 nt11.13□□□□□ -0.63
YRR1Q12172 KTR3YBR205W 1215 nt11.11□□□□□ -0.63
YRR1Q12172 BNA2YJR078W 1362 nt11.11□□□□□ -0.63
YRR1Q12172 SWE1YJL187C 2460 nt11.1□□□□□ -0.63
YRR1Q12172 RRT5YFR032C 870 nt11.1□□□□□ -0.63
YRR1Q12172 PEX25YPL112C 1185 nt11.1□□□□□ -0.63
YRR1Q12172 YFL066CYFL066C 1179 nt11.09□□□□□ -0.63
YRR1Q12172 PRE6YOL038W 765 nt11.09□□□□□ -0.63
YRR1Q12172 RSM23YGL129C 1353 nt11.08□□□□□ -0.64
YRR1Q12172 YNL115CYNL115C 1935 nt11.08□□□□□ -0.64
YRR1Q12172 YEL074WYEL074W 339 nt11.08□□□□□ -0.64
YRR1Q12172 YPL041CYPL041C 624 nt11.07□□□□□ -0.64
YRR1Q12172 NEM1YHR004C 1341 nt11.07□□□□□ -0.64
YRR1Q12172 LSM12YHR121W 564 nt11.06□□□□□ -0.64
YRR1Q12172 FTH1YBR207W 1398 nt11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.4 ms