Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD300CQ08708 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD300CQ08708 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD300CQ08708 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD300CQ08708 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD300CQ08708 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD300CQ08708 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD300CQ08708 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD300CQ08708 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD300CQ08708 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD300CQ08708 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD300CQ08708 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD300CQ08708 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD300CQ08708 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD300CQ08708 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CD300CQ08708 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD300CQ08708 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD300CQ08708 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD300CQ08708 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD300CQ08708 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD300CQ08708 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD300CQ08708 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD300CQ08708 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD300CQ08708 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD300CQ08708 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD300CQ08708 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD300CQ08708 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD300CQ08708 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD300CQ08708 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD300CQ08708 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD300CQ08708 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD300CQ08708 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD300CQ08708 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD300CQ08708 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD300CQ08708 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD300CQ08708 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD300CQ08708 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD300CQ08708 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD300CQ08708 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD300CQ08708 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD300CQ08708 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD300CQ08708 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD300CQ08708 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD300CQ08708 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD300CQ08708 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD300CQ08708 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD300CQ08708 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD300CQ08708 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD300CQ08708 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD300CQ08708 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD300CQ08708 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CD300CQ08708 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CD300CQ08708 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD300CQ08708 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD300CQ08708 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD300CQ08708 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD300CQ08708 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD300CQ08708 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD300CQ08708 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD300CQ08708 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD300CQ08708 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD300CQ08708 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD300CQ08708 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD300CQ08708 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD300CQ08708 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD300CQ08708 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD300CQ08708 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD300CQ08708 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD300CQ08708 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD300CQ08708 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD300CQ08708 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD300CQ08708 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD300CQ08708 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD300CQ08708 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD300CQ08708 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD300CQ08708 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD300CQ08708 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD300CQ08708 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD300CQ08708 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CD300CQ08708 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD300CQ08708 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD300CQ08708 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CD300CQ08708 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD300CQ08708 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD300CQ08708 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD300CQ08708 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD300CQ08708 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD300CQ08708 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD300CQ08708 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD300CQ08708 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD300CQ08708 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD300CQ08708 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD300CQ08708 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD300CQ08708 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD300CQ08708 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD300CQ08708 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD300CQ08708 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD300CQ08708 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD300CQ08708 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD300CQ08708 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms