Protein–RNA interactions for Protein: P82673

MRPS35, 28S ribosomal protein S35, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS35P82673 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MRPS35P82673 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MRPS35P82673 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MRPS35P82673 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MRPS35P82673 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MRPS35P82673 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MRPS35P82673 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MRPS35P82673 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MRPS35P82673 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MRPS35P82673 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MRPS35P82673 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MRPS35P82673 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MRPS35P82673 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MRPS35P82673 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MRPS35P82673 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MRPS35P82673 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MRPS35P82673 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MRPS35P82673 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MRPS35P82673 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MRPS35P82673 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MRPS35P82673 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MRPS35P82673 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MRPS35P82673 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MRPS35P82673 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MRPS35P82673 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MRPS35P82673 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MRPS35P82673 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MRPS35P82673 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MRPS35P82673 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MRPS35P82673 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MRPS35P82673 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MRPS35P82673 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MRPS35P82673 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MRPS35P82673 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MRPS35P82673 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MRPS35P82673 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MRPS35P82673 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MRPS35P82673 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MRPS35P82673 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MRPS35P82673 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MRPS35P82673 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MRPS35P82673 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MRPS35P82673 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MRPS35P82673 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MRPS35P82673 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MRPS35P82673 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
MRPS35P82673 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MRPS35P82673 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MRPS35P82673 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MRPS35P82673 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MRPS35P82673 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MRPS35P82673 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MRPS35P82673 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MRPS35P82673 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MRPS35P82673 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MRPS35P82673 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MRPS35P82673 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MRPS35P82673 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MRPS35P82673 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MRPS35P82673 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MRPS35P82673 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MRPS35P82673 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MRPS35P82673 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MRPS35P82673 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MRPS35P82673 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
MRPS35P82673 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MRPS35P82673 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MRPS35P82673 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MRPS35P82673 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MRPS35P82673 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MRPS35P82673 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
MRPS35P82673 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MRPS35P82673 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MRPS35P82673 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MRPS35P82673 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MRPS35P82673 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MRPS35P82673 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
MRPS35P82673 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MRPS35P82673 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MRPS35P82673 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
MRPS35P82673 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MRPS35P82673 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MRPS35P82673 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MRPS35P82673 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MRPS35P82673 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MRPS35P82673 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MRPS35P82673 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MRPS35P82673 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MRPS35P82673 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MRPS35P82673 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MRPS35P82673 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MRPS35P82673 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MRPS35P82673 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MRPS35P82673 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MRPS35P82673 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MRPS35P82673 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MRPS35P82673 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MRPS35P82673 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MRPS35P82673 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
MRPS35P82673 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms