Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNRPNP63162 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNRPNP63162 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SNRPNP63162 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNRPNP63162 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNRPNP63162 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNRPNP63162 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNRPNP63162 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNRPNP63162 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNRPNP63162 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNRPNP63162 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNRPNP63162 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNRPNP63162 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNRPNP63162 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNRPNP63162 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNRPNP63162 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SNRPNP63162 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNRPNP63162 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNRPNP63162 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNRPNP63162 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNRPNP63162 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNRPNP63162 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNRPNP63162 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNRPNP63162 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SNRPNP63162 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNRPNP63162 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNRPNP63162 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNRPNP63162 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNRPNP63162 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNRPNP63162 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNRPNP63162 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNRPNP63162 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNRPNP63162 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SNRPNP63162 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNRPNP63162 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNRPNP63162 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNRPNP63162 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNRPNP63162 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SNRPNP63162 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNRPNP63162 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNRPNP63162 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNRPNP63162 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNRPNP63162 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SNRPNP63162 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNRPNP63162 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNRPNP63162 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNRPNP63162 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNRPNP63162 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNRPNP63162 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNRPNP63162 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SNRPNP63162 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNRPNP63162 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNRPNP63162 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNRPNP63162 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNRPNP63162 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNRPNP63162 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNRPNP63162 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNRPNP63162 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SNRPNP63162 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNRPNP63162 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNRPNP63162 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNRPNP63162 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SNRPNP63162 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNRPNP63162 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNRPNP63162 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNRPNP63162 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNRPNP63162 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNRPNP63162 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNRPNP63162 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNRPNP63162 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SNRPNP63162 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNRPNP63162 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNRPNP63162 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNRPNP63162 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNRPNP63162 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNRPNP63162 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNRPNP63162 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SNRPNP63162 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SNRPNP63162 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNRPNP63162 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNRPNP63162 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNRPNP63162 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNRPNP63162 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNRPNP63162 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNRPNP63162 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNRPNP63162 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNRPNP63162 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNRPNP63162 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNRPNP63162 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNRPNP63162 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SNRPNP63162 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNRPNP63162 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNRPNP63162 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SNRPNP63162 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNRPNP63162 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNRPNP63162 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNRPNP63162 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNRPNP63162 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNRPNP63162 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNRPNP63162 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms