Protein–RNA interactions for Protein: P62760

VSNL1, Visinin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSNL1P62760 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
VSNL1P62760 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
VSNL1P62760 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
VSNL1P62760 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
VSNL1P62760 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
VSNL1P62760 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
VSNL1P62760 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
VSNL1P62760 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
VSNL1P62760 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
VSNL1P62760 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VSNL1P62760 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VSNL1P62760 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
VSNL1P62760 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
VSNL1P62760 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
VSNL1P62760 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
VSNL1P62760 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
VSNL1P62760 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
VSNL1P62760 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
VSNL1P62760 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VSNL1P62760 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
VSNL1P62760 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VSNL1P62760 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VSNL1P62760 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
VSNL1P62760 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
VSNL1P62760 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VSNL1P62760 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VSNL1P62760 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VSNL1P62760 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VSNL1P62760 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
VSNL1P62760 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
VSNL1P62760 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
VSNL1P62760 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
VSNL1P62760 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
VSNL1P62760 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
VSNL1P62760 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
VSNL1P62760 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
VSNL1P62760 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
VSNL1P62760 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
VSNL1P62760 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
VSNL1P62760 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
VSNL1P62760 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
VSNL1P62760 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
VSNL1P62760 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
VSNL1P62760 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
VSNL1P62760 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
VSNL1P62760 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
VSNL1P62760 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VSNL1P62760 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
VSNL1P62760 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
VSNL1P62760 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
VSNL1P62760 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VSNL1P62760 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
VSNL1P62760 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VSNL1P62760 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VSNL1P62760 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
VSNL1P62760 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VSNL1P62760 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
VSNL1P62760 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
VSNL1P62760 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VSNL1P62760 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
VSNL1P62760 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
VSNL1P62760 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
VSNL1P62760 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
VSNL1P62760 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VSNL1P62760 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
VSNL1P62760 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VSNL1P62760 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
VSNL1P62760 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
VSNL1P62760 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
VSNL1P62760 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
VSNL1P62760 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
VSNL1P62760 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VSNL1P62760 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
VSNL1P62760 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
VSNL1P62760 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
VSNL1P62760 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
VSNL1P62760 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
VSNL1P62760 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
VSNL1P62760 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
VSNL1P62760 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
VSNL1P62760 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
VSNL1P62760 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
VSNL1P62760 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
VSNL1P62760 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
VSNL1P62760 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
VSNL1P62760 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
VSNL1P62760 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
VSNL1P62760 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
VSNL1P62760 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VSNL1P62760 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VSNL1P62760 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VSNL1P62760 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VSNL1P62760 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VSNL1P62760 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
VSNL1P62760 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
VSNL1P62760 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
VSNL1P62760 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
VSNL1P62760 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
VSNL1P62760 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
VSNL1P62760 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms