Protein–RNA interactions for Protein: P62249

RPS16, 40S ribosomal protein S16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS16P62249 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS16P62249 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS16P62249 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS16P62249 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS16P62249 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS16P62249 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS16P62249 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS16P62249 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS16P62249 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS16P62249 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS16P62249 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS16P62249 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS16P62249 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS16P62249 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS16P62249 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS16P62249 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS16P62249 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS16P62249 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS16P62249 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS16P62249 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS16P62249 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS16P62249 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS16P62249 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS16P62249 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RPS16P62249 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS16P62249 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS16P62249 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS16P62249 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS16P62249 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS16P62249 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS16P62249 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS16P62249 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS16P62249 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS16P62249 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS16P62249 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS16P62249 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS16P62249 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS16P62249 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS16P62249 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS16P62249 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS16P62249 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS16P62249 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS16P62249 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS16P62249 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS16P62249 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS16P62249 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS16P62249 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS16P62249 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS16P62249 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS16P62249 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS16P62249 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS16P62249 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS16P62249 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS16P62249 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS16P62249 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS16P62249 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS16P62249 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS16P62249 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS16P62249 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS16P62249 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS16P62249 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS16P62249 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS16P62249 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS16P62249 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS16P62249 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS16P62249 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS16P62249 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS16P62249 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS16P62249 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS16P62249 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS16P62249 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS16P62249 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS16P62249 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS16P62249 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS16P62249 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS16P62249 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS16P62249 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS16P62249 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS16P62249 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS16P62249 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS16P62249 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS16P62249 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS16P62249 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS16P62249 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS16P62249 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS16P62249 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS16P62249 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS16P62249 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RPS16P62249 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS16P62249 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS16P62249 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS16P62249 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS16P62249 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS16P62249 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS16P62249 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS16P62249 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS16P62249 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS16P62249 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS16P62249 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS16P62249 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms