Protein–RNA interactions for Protein: P51812

RPS6KA3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA3P51812 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPS6KA3P51812 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPS6KA3P51812 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPS6KA3P51812 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPS6KA3P51812 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPS6KA3P51812 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPS6KA3P51812 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPS6KA3P51812 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RPS6KA3P51812 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPS6KA3P51812 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPS6KA3P51812 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPS6KA3P51812 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPS6KA3P51812 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPS6KA3P51812 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPS6KA3P51812 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPS6KA3P51812 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPS6KA3P51812 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPS6KA3P51812 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPS6KA3P51812 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPS6KA3P51812 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPS6KA3P51812 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPS6KA3P51812 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPS6KA3P51812 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RPS6KA3P51812 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPS6KA3P51812 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPS6KA3P51812 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RPS6KA3P51812 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPS6KA3P51812 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPS6KA3P51812 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPS6KA3P51812 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPS6KA3P51812 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPS6KA3P51812 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RPS6KA3P51812 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPS6KA3P51812 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPS6KA3P51812 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPS6KA3P51812 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPS6KA3P51812 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPS6KA3P51812 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPS6KA3P51812 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPS6KA3P51812 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RPS6KA3P51812 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPS6KA3P51812 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPS6KA3P51812 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPS6KA3P51812 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPS6KA3P51812 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPS6KA3P51812 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPS6KA3P51812 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPS6KA3P51812 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPS6KA3P51812 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPS6KA3P51812 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPS6KA3P51812 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPS6KA3P51812 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPS6KA3P51812 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPS6KA3P51812 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPS6KA3P51812 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPS6KA3P51812 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPS6KA3P51812 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPS6KA3P51812 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPS6KA3P51812 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RPS6KA3P51812 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPS6KA3P51812 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPS6KA3P51812 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPS6KA3P51812 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPS6KA3P51812 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPS6KA3P51812 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPS6KA3P51812 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPS6KA3P51812 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPS6KA3P51812 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RPS6KA3P51812 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPS6KA3P51812 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPS6KA3P51812 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPS6KA3P51812 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPS6KA3P51812 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPS6KA3P51812 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPS6KA3P51812 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
RPS6KA3P51812 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPS6KA3P51812 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPS6KA3P51812 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPS6KA3P51812 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPS6KA3P51812 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPS6KA3P51812 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPS6KA3P51812 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPS6KA3P51812 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPS6KA3P51812 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPS6KA3P51812 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPS6KA3P51812 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPS6KA3P51812 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPS6KA3P51812 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPS6KA3P51812 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPS6KA3P51812 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPS6KA3P51812 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPS6KA3P51812 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPS6KA3P51812 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPS6KA3P51812 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPS6KA3P51812 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPS6KA3P51812 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RPS6KA3P51812 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPS6KA3P51812 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPS6KA3P51812 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPS6KA3P51812 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms