Protein–RNA interactions for Protein: P48567

PUS4, tRNA pseudouridine synthase 4, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUS4P48567 YIH1YCR059C 777 nt9.18□□□□□ -0.94
PUS4P48567 CYT2YKL087C 675 nt9.18□□□□□ -0.94
PUS4P48567 RTG1YOL067C 534 nt9.18□□□□□ -0.94
PUS4P48567 BSP1YPR171W 1731 nt9.18□□□□□ -0.94
PUS4P48567 RNQ1YCL028W 1218 nt9.18□□□□□ -0.94
PUS4P48567 SIM1YIL123W 1431 nt9.16□□□□□ -0.94
PUS4P48567 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt9.15□□□□□ -0.94
PUS4P48567 LYS4YDR234W 2082 nt9.15□□□□□ -0.94
PUS4P48567 AQY1YPR192W 918 nt9.14□□□□□ -0.95
PUS4P48567 ERF2YLR246W 1080 nt9.13□□□□□ -0.95
PUS4P48567 Q0010Q0010 387 nt9.13□□□□□ -0.95
PUS4P48567 SPP1YPL138C 1062 nt9.12□□□□□ -0.95
PUS4P48567 DIC1YLR348C 897 nt9.11□□□□□ -0.95
PUS4P48567 BIO5YNR056C 1686 nt9.1□□□□□ -0.95
PUS4P48567 PBP1YGR178C 2169 nt9.1□□□□□ -0.95
PUS4P48567 YKL030WYKL030W 606 nt9.09□□□□□ -0.95
PUS4P48567 YJR154WYJR154W 1041 nt9.08□□□□□ -0.96
PUS4P48567 SSN3YPL042C 1668 nt9.05□□□□□ -0.96
PUS4P48567 YFL067WYFL067W 528 nt9.05□□□□□ -0.96
PUS4P48567 TIM23YNR017W 669 nt9.05□□□□□ -0.96
PUS4P48567 YKR005CYKR005C 1578 nt9.03□□□□□ -0.96
PUS4P48567 HUA1YGR268C 597 nt9.03□□□□□ -0.96
PUS4P48567 YLL053CYLL053C 459 nt9.03□□□□□ -0.96
PUS4P48567 FTR1YER145C 1215 nt9.02□□□□□ -0.97
PUS4P48567 MET8YBR213W 825 nt9.02□□□□□ -0.97
PUS4P48567 PTH1YHR189W 573 nt9.01□□□□□ -0.97
PUS4P48567 CRR1YLR213C 1269 nt9.01□□□□□ -0.97
PUS4P48567 SNF1YDR477W 1902 nt9.01□□□□□ -0.97
PUS4P48567 CLB6YGR109C 1143 nt9□□□□□ -0.97
PUS4P48567 YLR179CYLR179C 606 nt8.99□□□□□ -0.97
PUS4P48567 YPR064WYPR064W 420 nt8.99□□□□□ -0.97
PUS4P48567 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt8.98□□□□□ -0.97
PUS4P48567 IRC24YIR036C 792 nt8.98□□□□□ -0.97
PUS4P48567 NDI1YML120C 1542 nt8.98□□□□□ -0.97
PUS4P48567 CCA1YER168C 1641 nt8.97□□□□□ -0.97
PUS4P48567 UBX6YJL048C 1191 nt8.96□□□□□ -0.98
PUS4P48567 DDR2YOL052C-A 186 nt8.96□□□□□ -0.98
PUS4P48567 GAL1YBR020W 1587 nt8.95□□□□□ -0.98
PUS4P48567 GID7YCL039W 2238 nt8.95□□□□□ -0.98
PUS4P48567 HSL7YBR133C 2484 nt8.95□□□□□ -0.98
PUS4P48567 YDR094WYDR094W 336 nt8.94□□□□□ -0.98
PUS4P48567 HEM12YDR047W 1089 nt8.93□□□□□ -0.98
PUS4P48567 RAX1YOR301W 1308 nt8.93□□□□□ -0.98
PUS4P48567 GPI16YHR188C 1833 nt8.93□□□□□ -0.98
PUS4P48567 WSC2YNL283C 1512 nt8.92□□□□□ -0.98
PUS4P48567 SPC25YER018C 666 nt8.92□□□□□ -0.98
PUS4P48567 YGR259CYGR259C 441 nt8.92□□□□□ -0.98
PUS4P48567 AHT1YHR093W 549 nt8.92□□□□□ -0.98
PUS4P48567 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt8.91□□□□□ -0.98
PUS4P48567 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt8.91□□□□□ -0.98
PUS4P48567 TRM5YHR070W 1500 nt8.9□□□□□ -0.99
PUS4P48567 TAD3YLR316C 969 nt8.89□□□□□ -0.99
PUS4P48567 STB1YNL309W 1263 nt8.89□□□□□ -0.99
PUS4P48567 ATF2YGR177C 1608 nt8.88□□□□□ -0.99
PUS4P48567 HEL2YDR266C 1920 nt8.87□□□□□ -0.99
PUS4P48567 MAS1YLR163C 1389 nt8.86□□□□□ -0.99
PUS4P48567 RDN25-1RDN25-1 3396 nt8.86□□□□□ -0.99
PUS4P48567 RDN25-2RDN25-2 3396 nt8.86□□□□□ -0.99
PUS4P48567 ANP1YEL036C 1503 nt8.85□□□□□ -0.99
PUS4P48567 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt8.85□□□□□ -0.99
PUS4P48567 MCM5YLR274W 2328 nt8.84□□□□□ -0.99
PUS4P48567 SNG1YGR197C 1644 nt8.83□□□□□ -1
PUS4P48567 RSC4YKR008W 1878 nt8.83□□□□□ -1
PUS4P48567 BNA2YJR078W 1362 nt8.83□□□□□ -1
PUS4P48567 CCT4YDL143W 1587 nt8.82□□□□□ -1
PUS4P48567 YCL074WYCL074W 927 nt8.82□□□□□ -1
PUS4P48567 YAT1YAR035W 2064 nt8.81□□□□□ -1
PUS4P48567 SWC5YBR231C 912 nt8.81□□□□□ -1
PUS4P48567 SPT20YOL148C 1815 nt8.8□□□□□ -1
PUS4P48567 DUS1YML080W 1272 nt8.8□□□□□ -1
PUS4P48567 FEN2YCR028C 1539 nt8.79□□□□□ -1
PUS4P48567 NPP1YCR026C 2229 nt8.77□□□□□ -1.01
PUS4P48567 MET2YNL277W 1461 nt8.77□□□□□ -1.01
PUS4P48567 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt8.76□□□□□ -1.01
PUS4P48567 YLR415CYLR415C 339 nt8.76□□□□□ -1.01
PUS4P48567 SFP1YLR403W 2052 nt8.74□□□□□ -1.01
PUS4P48567 VPS60YDR486C 690 nt8.74□□□□□ -1.01
PUS4P48567 MIC10YCL057C-A 294 nt8.74□□□□□ -1.01
PUS4P48567 YGR201CYGR201C 678 nt8.72□□□□□ -1.01
PUS4P48567 MIC12YBR262C 321 nt8.72□□□□□ -1.01
PUS4P48567 PAB1YER165W 1734 nt8.71□□□□□ -1.01
PUS4P48567 ESBP6YNL125C 2022 nt8.71□□□□□ -1.01
PUS4P48567 INA1YLR413W 2028 nt8.7□□□□□ -1.02
PUS4P48567 RIM8YGL045W 1629 nt8.69□□□□□ -1.02
PUS4P48567 YFR018CYFR018C 1092 nt8.69□□□□□ -1.02
PUS4P48567 YIR016WYIR016W 798 nt8.69□□□□□ -1.02
PUS4P48567 BDH1YAL060W 1149 nt8.67□□□□□ -1.02
PUS4P48567 TIM17YJL143W 477 nt8.64□□□□□ -1.03
PUS4P48567 PEX25YPL112C 1185 nt8.64□□□□□ -1.03
PUS4P48567 PUS7YOR243C 2031 nt8.64□□□□□ -1.03
PUS4P48567 YDR306CYDR306C 1437 nt8.63□□□□□ -1.03
PUS4P48567 ALG3YBL082C 1377 nt8.63□□□□□ -1.03
PUS4P48567 YSP3YOR003W 1437 nt8.63□□□□□ -1.03
PUS4P48567 YGL114WYGL114W 2178 nt8.62□□□□□ -1.03
PUS4P48567 ILV2YMR108W 2064 nt8.62□□□□□ -1.03
PUS4P48567 HHO1YPL127C 777 nt8.62□□□□□ -1.03
PUS4P48567 RRT5YFR032C 870 nt8.61□□□□□ -1.03
PUS4P48567 VPS75YNL246W 795 nt8.61□□□□□ -1.03
PUS4P48567 XDJ1YLR090W 1380 nt8.61□□□□□ -1.03
PUS4P48567 RPC82YPR190C 1965 nt8.58□□□□□ -1.04
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