Protein–RNA interactions for Protein: P47914

RPL29, 60S ribosomal protein L29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL29P47914 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL29P47914 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL29P47914 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL29P47914 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL29P47914 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL29P47914 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL29P47914 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL29P47914 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL29P47914 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL29P47914 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL29P47914 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL29P47914 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPL29P47914 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL29P47914 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL29P47914 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL29P47914 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL29P47914 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL29P47914 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL29P47914 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL29P47914 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL29P47914 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL29P47914 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL29P47914 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL29P47914 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL29P47914 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL29P47914 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL29P47914 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL29P47914 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL29P47914 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPL29P47914 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPL29P47914 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL29P47914 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL29P47914 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL29P47914 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL29P47914 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL29P47914 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL29P47914 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL29P47914 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL29P47914 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL29P47914 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL29P47914 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL29P47914 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL29P47914 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL29P47914 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL29P47914 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL29P47914 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL29P47914 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL29P47914 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL29P47914 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL29P47914 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL29P47914 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL29P47914 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL29P47914 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL29P47914 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL29P47914 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL29P47914 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL29P47914 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
RPL29P47914 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL29P47914 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL29P47914 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL29P47914 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL29P47914 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL29P47914 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL29P47914 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL29P47914 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL29P47914 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL29P47914 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL29P47914 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL29P47914 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL29P47914 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL29P47914 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL29P47914 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL29P47914 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL29P47914 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL29P47914 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL29P47914 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL29P47914 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL29P47914 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL29P47914 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL29P47914 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL29P47914 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL29P47914 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL29P47914 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL29P47914 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL29P47914 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL29P47914 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RPL29P47914 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RPL29P47914 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL29P47914 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL29P47914 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL29P47914 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL29P47914 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL29P47914 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL29P47914 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL29P47914 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL29P47914 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
RPL29P47914 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RPL29P47914 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL29P47914 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL29P47914 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms