Protein–RNA interactions for Protein: P38788

SSZ1, Ribosome-associated complex subunit SSZ1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSZ1P38788 MXR2YCL033C 507 nt10.26□□□□□ -0.77
SSZ1P38788 FMP45YDL222C 930 nt10.24□□□□□ -0.77
SSZ1P38788 BIO5YNR056C 1686 nt10.23□□□□□ -0.77
SSZ1P38788 FTR1YER145C 1215 nt10.23□□□□□ -0.77
SSZ1P38788 NME1NME1 340 nt10.22□□□□□ -0.77
SSZ1P38788 BMT6YLR063W 1098 nt10.21□□□□□ -0.77
SSZ1P38788 PBP1YGR178C 2169 nt10.2□□□□□ -0.78
SSZ1P38788 SNF1YDR477W 1902 nt10.19□□□□□ -0.78
SSZ1P38788 YKR005CYKR005C 1578 nt10.19□□□□□ -0.78
SSZ1P38788 FRD1YEL047C 1413 nt10.19□□□□□ -0.78
SSZ1P38788 WSC2YNL283C 1512 nt10.18□□□□□ -0.78
SSZ1P38788 GAL1YBR020W 1587 nt10.18□□□□□ -0.78
SSZ1P38788 ERV46YAL042W 1248 nt10.17□□□□□ -0.78
SSZ1P38788 PUS2YGL063W 1113 nt10.16□□□□□ -0.78
SSZ1P38788 DDR2YOL052C-A 186 nt10.16□□□□□ -0.78
SSZ1P38788 TRM5YHR070W 1500 nt10.16□□□□□ -0.78
SSZ1P38788 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.15□□□□□ -0.78
SSZ1P38788 YKR040CYKR040C 504 nt10.14□□□□□ -0.79
SSZ1P38788 ANP1YEL036C 1503 nt10.13□□□□□ -0.79
SSZ1P38788 YPR011CYPR011C 981 nt10.13□□□□□ -0.79
SSZ1P38788 YAT1YAR035W 2064 nt10.13□□□□□ -0.79
SSZ1P38788 MIC12YBR262C 321 nt10.12□□□□□ -0.79
SSZ1P38788 CYT2YKL087C 675 nt10.11□□□□□ -0.79
SSZ1P38788 DIC1YLR348C 897 nt10.11□□□□□ -0.79
SSZ1P38788 BNA2YJR078W 1362 nt10.11□□□□□ -0.79
SSZ1P38788 MET2YNL277W 1461 nt10.1□□□□□ -0.79
SSZ1P38788 YCL074WYCL074W 927 nt10.1□□□□□ -0.79
SSZ1P38788 AGP1YCL025C 1902 nt10.08□□□□□ -0.8
SSZ1P38788 IRC24YIR036C 792 nt10.08□□□□□ -0.8
SSZ1P38788 AQY1YPR192W 918 nt10.08□□□□□ -0.8
SSZ1P38788 SFP1YLR403W 2052 nt10.08□□□□□ -0.8
SSZ1P38788 YGR259CYGR259C 441 nt10.07□□□□□ -0.8
SSZ1P38788 LPX1YOR084W 1164 nt10.07□□□□□ -0.8
SSZ1P38788 DUS1YML080W 1272 nt10.02□□□□□ -0.81
SSZ1P38788 NPP1YCR026C 2229 nt10.02□□□□□ -0.81
SSZ1P38788 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.01□□□□□ -0.81
SSZ1P38788 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.01□□□□□ -0.81
SSZ1P38788 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.01□□□□□ -0.81
SSZ1P38788 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.01□□□□□ -0.81
SSZ1P38788 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.01□□□□□ -0.81
SSZ1P38788 SPC25YER018C 666 nt10□□□□□ -0.81
SSZ1P38788 STB1YNL309W 1263 nt9.99□□□□□ -0.81
SSZ1P38788 GID7YCL039W 2238 nt9.99□□□□□ -0.81
SSZ1P38788 FEN2YCR028C 1539 nt9.98□□□□□ -0.81
SSZ1P38788 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt9.98□□□□□ -0.81
SSZ1P38788 HHO1YPL127C 777 nt9.98□□□□□ -0.81
SSZ1P38788 SSN3YPL042C 1668 nt9.96□□□□□ -0.81
SSZ1P38788 GPI16YHR188C 1833 nt9.94□□□□□ -0.82
SSZ1P38788 XDJ1YLR090W 1380 nt9.92□□□□□ -0.82
SSZ1P38788 YGR201CYGR201C 678 nt9.92□□□□□ -0.82
SSZ1P38788 YIR016WYIR016W 798 nt9.9□□□□□ -0.82
SSZ1P38788 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.89□□□□□ -0.83
SSZ1P38788 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.89□□□□□ -0.83
SSZ1P38788 STR3YGL184C 1398 nt9.88□□□□□ -0.83
SSZ1P38788 VPS60YDR486C 690 nt9.86□□□□□ -0.83
SSZ1P38788 TIM23YNR017W 669 nt9.86□□□□□ -0.83
SSZ1P38788 CCT4YDL143W 1587 nt9.84□□□□□ -0.83
SSZ1P38788 MAE1YKL029C 2010 nt9.83□□□□□ -0.84
SSZ1P38788 YLR179CYLR179C 606 nt9.83□□□□□ -0.84
SSZ1P38788 YLR235CYLR235C 399 nt9.83□□□□□ -0.84
SSZ1P38788 HMG2YLR450W 3138 nt9.83□□□□□ -0.84
SSZ1P38788 NDI1YML120C 1542 nt9.82□□□□□ -0.84
SSZ1P38788 ALG3YBL082C 1377 nt9.81□□□□□ -0.84
SSZ1P38788 AHT1YHR093W 549 nt9.8□□□□□ -0.84
SSZ1P38788 TPO4YOR273C 1980 nt9.8□□□□□ -0.84
SSZ1P38788 RTN2YDL204W 1182 nt9.79□□□□□ -0.84
SSZ1P38788 PTH1YHR189W 573 nt9.78□□□□□ -0.84
SSZ1P38788 DUT1YBR252W 444 nt9.78□□□□□ -0.84
SSZ1P38788 SWC5YBR231C 912 nt9.76□□□□□ -0.85
SSZ1P38788 AQY2YLL052C 450 nt9.73□□□□□ -0.85
SSZ1P38788 RIM8YGL045W 1629 nt9.73□□□□□ -0.85
SSZ1P38788 UGA4YDL210W 1716 nt9.73□□□□□ -0.85
SSZ1P38788 GOR1YNL274C 1053 nt9.72□□□□□ -0.85
SSZ1P38788 GDH3YAL062W 1374 nt9.71□□□□□ -0.86
SSZ1P38788 AVT6YER119C 1347 nt9.7□□□□□ -0.86
SSZ1P38788 SPT20YOL148C 1815 nt9.68□□□□□ -0.86
SSZ1P38788 YGL114WYGL114W 2178 nt9.67□□□□□ -0.86
SSZ1P38788 YPR064WYPR064W 420 nt9.66□□□□□ -0.86
SSZ1P38788 ESBP6YNL125C 2022 nt9.66□□□□□ -0.86
SSZ1P38788 RPC82YPR190C 1965 nt9.63□□□□□ -0.87
SSZ1P38788 YKL030WYKL030W 606 nt9.63□□□□□ -0.87
SSZ1P38788 SPP1YPL138C 1062 nt9.61□□□□□ -0.87
SSZ1P38788 URA8YJR103W 1737 nt9.61□□□□□ -0.87
SSZ1P38788 ILV2YMR108W 2064 nt9.6□□□□□ -0.87
SSZ1P38788 TAD3YLR316C 969 nt9.6□□□□□ -0.87
SSZ1P38788 ACO2YJL200C 2370 nt9.58□□□□□ -0.88
SSZ1P38788 HIF1YLL022C 1158 nt9.57□□□□□ -0.88
SSZ1P38788 INA1YLR413W 2028 nt9.56□□□□□ -0.88
SSZ1P38788 GTB1YDR221W 2109 nt9.56□□□□□ -0.88
SSZ1P38788 ARP6YLR085C 1317 nt9.56□□□□□ -0.88
SSZ1P38788 DAT1YML113W 747 nt9.55□□□□□ -0.88
SSZ1P38788 PLB1YMR008C 1995 nt9.55□□□□□ -0.88
SSZ1P38788 ALD4YOR374W 1560 nt9.54□□□□□ -0.88
SSZ1P38788 SHM2YLR058C 1410 nt9.54□□□□□ -0.88
SSZ1P38788 BDH1YAL060W 1149 nt9.51□□□□□ -0.89
SSZ1P38788 NBP35YGL091C 987 nt9.5□□□□□ -0.89
SSZ1P38788 FRE6YLL051C 2139 nt9.5□□□□□ -0.89
SSZ1P38788 PRM5YIL117C 957 nt9.49□□□□□ -0.89
SSZ1P38788 YLR415CYLR415C 339 nt9.48□□□□□ -0.89
SSZ1P38788 DTR1YBR180W 1719 nt9.47□□□□□ -0.89
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