Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNCAP37840 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNCAP37840 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNCAP37840 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNCAP37840 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNCAP37840 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNCAP37840 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNCAP37840 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNCAP37840 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNCAP37840 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNCAP37840 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNCAP37840 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNCAP37840 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNCAP37840 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNCAP37840 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNCAP37840 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNCAP37840 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNCAP37840 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNCAP37840 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNCAP37840 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNCAP37840 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNCAP37840 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNCAP37840 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNCAP37840 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNCAP37840 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SNCAP37840 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNCAP37840 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNCAP37840 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNCAP37840 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNCAP37840 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNCAP37840 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SNCAP37840 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SNCAP37840 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNCAP37840 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNCAP37840 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNCAP37840 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNCAP37840 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNCAP37840 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNCAP37840 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNCAP37840 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SNCAP37840 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNCAP37840 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNCAP37840 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNCAP37840 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNCAP37840 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNCAP37840 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNCAP37840 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNCAP37840 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNCAP37840 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNCAP37840 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNCAP37840 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNCAP37840 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNCAP37840 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNCAP37840 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNCAP37840 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNCAP37840 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNCAP37840 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNCAP37840 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNCAP37840 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNCAP37840 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNCAP37840 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNCAP37840 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNCAP37840 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNCAP37840 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNCAP37840 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNCAP37840 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNCAP37840 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNCAP37840 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNCAP37840 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNCAP37840 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNCAP37840 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNCAP37840 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNCAP37840 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNCAP37840 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNCAP37840 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNCAP37840 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNCAP37840 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNCAP37840 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNCAP37840 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNCAP37840 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNCAP37840 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNCAP37840 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNCAP37840 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNCAP37840 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNCAP37840 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNCAP37840 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNCAP37840 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNCAP37840 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNCAP37840 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNCAP37840 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNCAP37840 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNCAP37840 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNCAP37840 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SNCAP37840 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNCAP37840 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNCAP37840 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNCAP37840 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNCAP37840 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNCAP37840 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNCAP37840 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms