Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR2IP36954 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR2IP36954 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR2IP36954 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
POLR2IP36954 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
POLR2IP36954 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR2IP36954 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR2IP36954 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2IP36954 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2IP36954 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR2IP36954 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR2IP36954 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR2IP36954 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2IP36954 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
POLR2IP36954 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2IP36954 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2IP36954 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2IP36954 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2IP36954 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2IP36954 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR2IP36954 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR2IP36954 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR2IP36954 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR2IP36954 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR2IP36954 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR2IP36954 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR2IP36954 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
POLR2IP36954 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR2IP36954 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR2IP36954 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR2IP36954 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR2IP36954 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR2IP36954 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR2IP36954 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR2IP36954 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR2IP36954 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR2IP36954 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR2IP36954 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR2IP36954 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2IP36954 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2IP36954 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR2IP36954 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR2IP36954 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR2IP36954 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2IP36954 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2IP36954 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2IP36954 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2IP36954 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2IP36954 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR2IP36954 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR2IP36954 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR2IP36954 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR2IP36954 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2IP36954 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2IP36954 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2IP36954 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2IP36954 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR2IP36954 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR2IP36954 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR2IP36954 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR2IP36954 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR2IP36954 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR2IP36954 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2IP36954 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2IP36954 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR2IP36954 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR2IP36954 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR2IP36954 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR2IP36954 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR2IP36954 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR2IP36954 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR2IP36954 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR2IP36954 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR2IP36954 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR2IP36954 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR2IP36954 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR2IP36954 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR2IP36954 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR2IP36954 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2IP36954 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR2IP36954 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR2IP36954 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2IP36954 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR2IP36954 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR2IP36954 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR2IP36954 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR2IP36954 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR2IP36954 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2IP36954 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR2IP36954 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR2IP36954 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR2IP36954 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR2IP36954 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR2IP36954 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR2IP36954 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR2IP36954 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR2IP36954 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR2IP36954 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR2IP36954 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR2IP36954 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms