Protein–RNA interactions for Protein: P35749

MYH11, Myosin-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH11P35749 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
MYH11P35749 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
MYH11P35749 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
MYH11P35749 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
MYH11P35749 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
MYH11P35749 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
MYH11P35749 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
MYH11P35749 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
MYH11P35749 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
MYH11P35749 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
MYH11P35749 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
MYH11P35749 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
MYH11P35749 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
MYH11P35749 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
MYH11P35749 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
MYH11P35749 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
MYH11P35749 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
MYH11P35749 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
MYH11P35749 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
MYH11P35749 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
MYH11P35749 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
MYH11P35749 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
MYH11P35749 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
MYH11P35749 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
MYH11P35749 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
MYH11P35749 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
MYH11P35749 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
MYH11P35749 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
MYH11P35749 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
MYH11P35749 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
MYH11P35749 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
MYH11P35749 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
MYH11P35749 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
MYH11P35749 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.54■■■□□ 2.48
MYH11P35749 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
MYH11P35749 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
MYH11P35749 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
MYH11P35749 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
MYH11P35749 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
MYH11P35749 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
MYH11P35749 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
MYH11P35749 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
MYH11P35749 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
MYH11P35749 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
MYH11P35749 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
MYH11P35749 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
MYH11P35749 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
MYH11P35749 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
MYH11P35749 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
MYH11P35749 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
MYH11P35749 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
MYH11P35749 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
MYH11P35749 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
MYH11P35749 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
MYH11P35749 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
MYH11P35749 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
MYH11P35749 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
MYH11P35749 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
MYH11P35749 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
MYH11P35749 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
MYH11P35749 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
MYH11P35749 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
MYH11P35749 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
MYH11P35749 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
MYH11P35749 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
MYH11P35749 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
MYH11P35749 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
MYH11P35749 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
MYH11P35749 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
MYH11P35749 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
MYH11P35749 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
MYH11P35749 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
MYH11P35749 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
MYH11P35749 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
MYH11P35749 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
MYH11P35749 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
MYH11P35749 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
MYH11P35749 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
MYH11P35749 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
MYH11P35749 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
MYH11P35749 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
MYH11P35749 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
MYH11P35749 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
MYH11P35749 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
MYH11P35749 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
MYH11P35749 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
MYH11P35749 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
MYH11P35749 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
MYH11P35749 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
MYH11P35749 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
MYH11P35749 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
MYH11P35749 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
MYH11P35749 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
MYH11P35749 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
MYH11P35749 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
MYH11P35749 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
MYH11P35749 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
MYH11P35749 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
MYH11P35749 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
MYH11P35749 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms